RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF212Q9UDV6 495 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PLAGL2Q9UPG8 496 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ALG6Q9Y672 507 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 NPTX2P47972 431 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ST8SIA6P61647 398 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FEZF2Q8TBJ5 459 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKS1AQ92625 1134 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC13A1Q9BZW2 595 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1257Q9ULG3 409 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 NFIBO00712 420 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GYG2O15488 501 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 STAG3L1P0CL83 205 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TGFB3P10600 412 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 FKBP1CQ5VVH2 108 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MTSS1O43312 755 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SMIM24O75264 130 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 MPZL3Q6UWV2 235 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL7BQ6UX53 244 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATC1LQ9H0A9 340 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PPCSQ9HAB8 311 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PAK5Q9P286 719 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PGK2P07205 417 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.15■□□□□ 0.346e-7■■■■□ 26.6
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRC5CQ9NQ84 441 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 THEGQ9P2T0 379 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 HAUS5O94927 633 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 CLCN3P51790 818 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 BOLA3Q53S33 107 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF6Q58WW2 860 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 DPP3Q9NY33 737 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF197O14709 1029 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 PLSCR1O15162 318 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 CDH16O75309 829 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GRAP2O75791 330 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ESRRBO95718 433 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RSPH10BP0C881 870 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 THPOP40225 353 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 ARFIP2P53365 341 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 GIT2Q14161 759 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 RASIP1Q5U651 963 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM65Q6PJ69 517 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC7A14Q8TBB6 771 aa17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.34
SH3BP4-201ENST00000344528 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ODC1P11926 461 aa17.14■□□□□ 0.33
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SH3BP4-201ENST00000344528 VSNL1P62760 191 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP18Q8N392 663 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 GRAMD1AQ96CP6 724 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 AGAP3Q96P47 875 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFP69BQ9UJL9 534 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 L3MBTL1Q9Y468 752 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF185O15231 689 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC6O75061 913 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 MLXIPLQ9NP71 852 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 MYBPC2Q14324 1141 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf22Q6V702 233 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DCUN1D1Q96GG9 259 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 MS4A14Q96JA4 679 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC37BQ96QE4 947 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 COLEC11Q9BWP8 271 aa17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 HMBSP08397 361 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 FGFR4P22455 802 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCY2CP25092 1073 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 BRD2P25440 801 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP4-201ENST00000344528 OAZ1P54368 228 aa17.13■□□□□ 0.33
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SH3BP4-201ENST00000344528 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 DACT2Q5SW24 774 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT80Q6KB66 452 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM117BQ6P1L5 589 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CBWD2Q8IUF1 395 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC138Q96M89 665 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNF1Q9H3M0 494 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 NAGPAQ9UK23 515 aa17.13■□□□□ 0.33
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K7O43318 606 aa17.13■□□□□ 0.33
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