RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.72■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 IGSF21Q96ID5 467 aa22.72■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 FAM81BQ96LP2 452 aa22.72■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.72■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 MMS19Q96T76 1030 aa22.72■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 PLVAPQ9BX97 442 aa22.72■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 28.7
YBX1-201ENST00000321358 SNX9Q9Y5X1 595 aa22.72■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 HUS1O60921 280 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 SLC9A1P19634 815 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 PON1P27169 355 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 PBX2P40425 430 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 LRMPQ12912 555 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.71■■□□□ 1.23
YBX1-201ENST00000321358 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.71■■□□□ 1.23
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YBX1-201ENST00000321358 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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YBX1-201ENST00000321358 RB1P06400 928 aa22.7■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 NEK11Q8NG66 645 aa22.7■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 SENP8Q96LD8 212 aa22.7■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.7■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.7■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 GDAP2Q9NXN4 497 aa22.7■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 LAMA3Q16787 3333 aa22.7■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 CYB561D2O14569 222 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 SPTLC1O15269 473 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 SLC34A2O95436 690 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 ODC1P11926 461 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 DNAJB2P25686 324 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 TIGD5Q53EQ6 642 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 FUT10Q6P4F1 479 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 METTL23Q86XA0 190 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 PPM1KQ8N3J5 372 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 APPL2Q8NEU8 664 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 LMO3Q8TAP4 145 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 TIFAQ96CG3 184 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 SUSD3Q96L08 255 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 MARCH5Q9NX47 278 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 DSEQ9UL01 958 aa22.69■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 FSD2A1L4K1 749 aa22.68■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 FGF18O76093 207 aa22.68■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 KCNMA1Q12791 1236 aa22.68■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.68■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 DPH6Q7L8W6 267 aa22.68■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.68■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 F8W810 466 aa22.67■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 TAP1Q03518 808 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.67■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
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YBX1-201ENST00000321358 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 TMEM86AQ8N2M4 240 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.67■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 TRIP11Q15643 1979 aa22.66■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.66■■□□□ 1.22
YBX1-201ENST00000321358 I3L4J1 428 aa22.66■■□□□ 1.22
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