RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 WASHC2DQ5SRD0 308 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 FYB2Q5VWT5 728 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 CYP4F22Q6NT55 531 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 FAM47EQ6ZV65 393 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 MON1BQ7L1V2 547 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 RCOR2Q8IZ40 523 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 ZNF398Q8TD17 642 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 FBXO41Q8TF61 875 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 HEMGNQ9BXL5 484 aa14.67□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 TJP3O95049 919 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 LMNAP02545 664 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 KRT15P19012 456 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 MORF4L2Q15014 288 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 CMPK2Q5EBM0 449 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 HHATQ5VTY9 493 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 CPA5Q8WXQ8 436 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 ERP27Q96DN0 273 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 IP6K2Q9UHH9 426 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 KCNG1Q9UIX4 513 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 NFASCO94856 1347 aa14.66□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 A8MUI8 341 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 CALB2P22676 271 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 PAX7P23759 505 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 MCL1Q07820 350 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 MOGSQ13724 837 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 TAF11Q15544 211 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 TMEM63BQ5T3F8 832 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 TUBB6Q9BUF5 446 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 GPRC5CQ9NQ84 441 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 LIASO43766 372 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 ZWINTO95229 277 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 FDX1P10109 184 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 SSR1P43307 286 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 CENPUQ71F23 418 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 SAR1AQ9NR31 198 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 PARVAQ9NVD7 372 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 FETUBQ9UGM5 382 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 ARID2Q68CP9 1835 aa14.65□□□□□ -0.06
MKS1-201ENST00000313863 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CA4P22748 312 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PHBP35232 272 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PTGER2P43116 358 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 RTP1P59025 263 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 DNAJC3Q13217 504 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 BLMHQ13867 455 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LRRC38Q5VT99 294 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PCGF5Q86SE9 256 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FAM151AQ8WW52 585 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 PWWP2AQ96N64 755 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 CHKBQ9Y259 395 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ABLIM1O14639 778 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 SPAG7O75391 227 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ADCY1Q08828 1119 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MAMLD1Q13495 774 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ALLCQ8N6M5 410 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 STK32AQ8WU08 396 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 BICD1Q96G01 975 aa14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
MKS1-201ENST00000313863 FNBP1Q96RU3 617 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms