RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 CCDC159P0C7I6 412 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 C2CD6Q53TS8 623 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 TEX2Q8IWB9 1127 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 CCT7Q99832 543 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 MYBL2P10244 700 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 OVGP1Q12889 678 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 GALNT4Q8N4A0 578 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 PXDNQ92626 1479 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 AKAP3O75969 853 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 UBOX5O94941 541 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 KLHL2O95198 593 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 APRTP07741 180 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 ACTR2P61160 394 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 SEMA4AQ9H3S1 761 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF302Q9NR11 478 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 PRR12Q9ULL5 1215 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 C21orf2O43822 256 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 PLA2G4FQ68DD2 849 aa19.6■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 F8VZ95 297 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 ITIH4Q14624 930 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 INPP5AQ14642 412 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 MEA1Q16626 185 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 HAO1Q9UJM8 370 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 KCNMA1Q12791 1236 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 RCN1Q15293 331 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 STXBP2Q15833 593 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 RAB6BQ9NRW1 208 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 DONSONQ9NYP3 566 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 RARGP13631 454 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 FNTAP49354 379 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 ITPK1Q13572 414 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 METTL23Q86XA0 190 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 FSD1LQ9BXM9 530 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 SLIT1O75093 1534 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 KCNN4O15554 427 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 SNX2O60749 519 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 SGPL1O95470 568 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 OSBPP22059 807 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 PSMD7P51665 324 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 ZCWPW2Q504Y3 356 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 PPP1R36Q96LQ0 422 aa19.59■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 ATP6V1B1P15313 513 aa19.58■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa19.58■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 CMTM5Q96DZ9 223 aa19.58■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 NYAP2Q9P242 653 aa19.58■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 GTF3C4Q9UKN8 822 aa19.58■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa19.58■□□□□ 0.73
PRKCI-201ENST00000295797 MSH4O15457 936 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 AKAP10O43572 662 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 ESRRBO95718 433 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF844Q08AG5 666 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 PTK7Q13308 1070 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 DUOXA2Q1HG44 320 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 TTMPQ5BVD1 217 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 RNF139Q8WU17 664 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 MYOM1P52179 1685 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 SLC5A4Q9NY91 659 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 FAM8A1Q9UBU6 413 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 PHTF1Q9UMS5 762 aa19.58■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 GIT2Q14161 759 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 PIK3R5Q8WYR1 880 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 C16orf96A6NNT2 1141 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 NEMP1O14524 444 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 ATP8B4Q8TF62 1192 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 KDM4CQ9H3R0 1056 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 SLC13A4Q9UKG4 626 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 AIM2O14862 343 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 SPP2Q13103 211 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 SMTNL2Q2TAL5 461 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 WDR72Q3MJ13 1102 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 KIF17Q9P2E2 1029 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 TECPR2O15040 1411 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 RCCD1A6NED2 376 aa19.57■□□□□ 0.72
PRKCI-201ENST00000295797 E7ENQ6 273 aa19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms