RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 ABHD2P08910 425 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 CREB1P16220 341 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 GNA15P30679 374 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 DSG3P32926 999 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 XKR3Q5GH77 459 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 WLSQ5T9L3 541 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 IZUMO3Q5VZ72 239 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 SLFN12LQ6IEE8 588 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 DOCK1Q14185 1865 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 SIP14410 1827 aa29.71■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 C2CD6Q53TS8 623 aa29.7■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 ABHD15Q6UXT9 468 aa29.7■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 FAM228AQ86W67 206 aa29.7■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 NLGN2Q8NFZ4 835 aa29.7■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 FAM84AQ96KN4 292 aa29.7■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 ABCF3Q9NUQ8 709 aa29.7■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
UBP1-201ENST00000283628 STAM2O75886 525 aa29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 LDHAP00338 332 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 KLRC2P26717 231 aa29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 VPS41P49754 854 aa29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 OAZ1P54368 228 aa29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 ACTR2P61160 394 aa29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 NUGGCQ68CJ6 796 aa29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 PARVAQ9NVD7 372 aa29.7■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 RGS20O76081 388 aa29.69■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 EMC2Q15006 297 aa29.69■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 SPOPLQ6IQ16 392 aa29.69■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD42Q8N9B4 389 aa29.69■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 IP6K2Q9UHH9 426 aa29.69■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 DCAF15Q66K64 600 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 TMEM270Q6UE05 265 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 ZNF112Q9UJU3 913 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 TLR3O15455 904 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 GJB6O95452 261 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 CLTAP09496 248 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 ACOT2P49753 483 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 WNT7BP56706 349 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 RIPK1Q13546 671 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 FEZF2Q8TBJ5 459 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 MAGEB18Q96M61 343 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 EURLQ9NYK6 297 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 PTPRJQ12913 1337 aa29.68■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 STX2P32856 288 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 MAP2K2P36507 400 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 GALNTL6Q49A17 601 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 MTERF2Q49AM1 385 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 SPATA21Q7Z572 469 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 PASD1Q8IV76 773 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 RCOR2Q8IZ40 523 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 WNK4Q96J92 1243 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 CGRRF1Q99675 332 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 ATP6V1G2O95670 118 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 CFHP08603 1231 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 NR1H3Q13133 447 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 MPP2Q14168 576 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 GNPTABQ3T906 1256 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 GSTA5Q7RTV2 222 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 REPS2Q8NFH8 660 aa29.67■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 UBOX5O94941 541 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 CD58P19256 250 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 NAMPTP43490 491 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP29.66■■■□□ 2.343e-7■■□□□ 11.7
UBP1-201ENST00000283628 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 CYP4X1Q8N118 509 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD35Q8N283 1001 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 CFAP57Q96MR6 1250 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 PWWP2AQ96N64 755 aa29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
UBP1-201ENST00000283628 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa29.65■■■□□ 2.34
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