RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 TAC1P20366 129 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 RAB15P59190 212 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SLC29A2Q14542 456 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 COG4Q9H9E3 785 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 MTHFD1LQ6UB35 978 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 GDPD5Q8WTR4 605 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 MAGED4Q96JG8 741 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PLA2G12BQ9BX93 195 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 GRIP2Q9C0E4 1043 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.05■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SNTNA6NMZ2 147 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 RFX1P22670 979 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PIGSQ96S52 555 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 EHD4Q9H223 541 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 MYRFQ9Y2G1 1151 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 DPPA5A6NC42 116 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PSMG1O95456 288 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PTGS2P35354 604 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 NR1H2P55055 460 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 GDAQ9Y2T3 454 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 AK5Q9Y6K8 562 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 NFKBIAP25963 317 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SOX6P35712 828 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TNFAIP2Q03169 654 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 MROH7Q68CQ1 1323 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 WDR64B1ANS9 1081 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL41O60662 606 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 KRT17Q04695 432 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SCYL2Q6P3W7 929 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ARMCX2Q7L311 632 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ERP44Q9BS26 406 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ISCA1Q9BUE6 129 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM245Q9H330 911 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SEC31BQ9NQW1 1179 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 HPS5Q9UPZ3 1129 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.04■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 EVPLLA8MZ36 301 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 DLATP10515 647 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 CDC25AP30304 524 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TSGA10IPQ3SY00 556 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SUSD4Q5VX71 490 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TTC27Q6P3X3 843 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PPM1NQ8N819 430 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 MAB21L3Q8N8X9 362 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TATDN2Q93075 761 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 APOL6Q9BWW8 343 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 USP1O94782 785 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 CASP5P51878 434 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PRKG1Q13976 671 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 C4orf33Q8N1A6 199 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 MTERF3Q96E29 417 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 CEP170P1Q96L14 293 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ANO3Q9BYT9 981 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 COL15A1P39059 1388 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PSTPIP1O43586 416 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PLA2G4BP0C869 781 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SFNP31947 248 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 GPC5P78333 572 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 XRCC4Q13426 336 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 UNC13DQ70J99 1090 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 GJA10Q969M2 543 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ZBTB18Q99592 522 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 A0A087WXM4 84 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PGM3O95394 542 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 KYAT1Q16773 422 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 ASZ1Q8WWH4 475 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 TAGLN3Q9UI15 199 aa15.03■□□□□ -0
PTPRO-201ENST00000281171 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms