RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 FCGR1AP12314 374 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ADORA2BP29275 332 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ACADSBP45954 432 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 RAB14P61106 215 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 HPCAP84074 193 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 NAB2Q15742 525 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 STRNO43815 780 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.35□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 H7C1W4 665 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ADRA2BP18089 450 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 VCAM1P19320 739 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 MMGT1Q8N4V1 131 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ZBTB22O15209 634 aa8.35□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 PTPRN2Q92932 1015 aa8.35□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 HPS4Q9NQG7 708 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 RGS4P49798 205 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 COPAP53621 1224 aa8.35□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 C18orf8Q96DM3 657 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 VPS50Q96JG6 964 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 O00370 1275 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 MAPK1P28482 360 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 SERPINB3P29508 390 aa8.35□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 CIAPIN1Q6FI81 312 aa8.35□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 SLC38A7Q9NVC3 462 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 NMRK1Q9NWW6 199 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ALKQ9UM73 1620 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 GPR162Q16538 588 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ANKRD7Q92527 254 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 EPC1Q9H2F5 836 aa8.35□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 CLMNQ96JQ2 1002 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 COL15A1P39059 1388 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 MYO1GB0I1T2 1018 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 MANSC1Q9H8J5 431 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 DYRK4Q9NR20 520 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 CFAP99D6REC4 459 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2ADP20671 130 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 NME3Q13232 169 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 TMEM154Q6P9G4 183 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 RNF135Q8IUD6 432 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 HIST1H2AJQ99878 128 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 H2AFJQ9BTM1 129 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 TBX3O15119 743 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 CRKP46108 304 aa8.34□□□□□ -1.07
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LIMD1-201ENST00000273317 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 KYNUQ16719 465 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 CCDC142Q17RM4 750 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 TKFCQ3LXA3 575 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 GPR141Q7Z602 305 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 SNX31Q8N9S9 440 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 ERP27Q96DN0 273 aa8.34□□□□□ -1.07
LIMD1-201ENST00000273317 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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