RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 CCT8L1PA6NM43 557 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SPAG6O75602 509 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SHMT1P34896 483 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 AP2B1P63010 937 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 CDC42EP1Q00587 391 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SERPINB12Q96P63 405 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 ELP3Q9H9T3 547 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 OSGEPQ9NPF4 335 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 RNF181Q9P0P0 153 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PAK5Q9P286 719 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MORF4L2Q15014 288 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PGBD4Q96DM1 585 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP2BQ9UQN3 213 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 CYP11B1P15538 503 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SYCP2LQ5T4T6 812 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MDM1Q8TC05 714 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 NPTX2P47972 431 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 RASSF3Q86WH2 238 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC71Q8N4P6 559 aa18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 ATP9BO43861 1147 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 BMP6P22004 513 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 IL1RL1Q01638 556 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MEA1Q16626 185 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 FBXO25Q8TCJ0 367 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 RAPGEF5Q92565 580 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 EPAS1Q99814 870 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 GLI1P08151 1106 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM119Q4V9L6 283 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 ERP27Q96DN0 273 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 NDE1Q9NXR1 346 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 GSTA4O15217 222 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 RARGP13631 454 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 GARTP22102 1010 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 ELF1P32519 619 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MTHFD1LQ6UB35 978 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 ATP8B4Q8TF62 1192 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 CYP4F11Q9HBI6 524 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 HBP1O60381 514 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 CAVIN3Q969G5 261 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC138Q96M89 665 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 FGD4Q96M96 766 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM62Q9BVG3 475 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 NPHS2Q9NP85 383 aa18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PGM1P36871 562 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SERPINB9P50453 376 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 HSD17B4P51659 736 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TMC2Q8TDI7 906 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 IFT43Q96FT9 208 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 CENPKQ9BS16 269 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 ORC6Q9Y5N6 252 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 GRAP2O75791 330 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PDHA1P08559 390 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PRAMEP78395 509 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SMTNL2Q2TAL5 461 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF507Q8TCN5 953 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TLR10Q9BXR5 811 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TPI1P60174 286 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SAMD3Q8N6K7 520 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SLC25A27O95847 323 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 RPS12P25398 132 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SCFD2Q8WU76 684 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 MED15Q96RN5 788 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 FAM167BQ9BTA0 163 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 GGA3Q9NZ52 723 aa18.49■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TTC36A6NLP5 189 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 CLGNO14967 610 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PSTPIP1O43586 416 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 PTK7Q13308 1070 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TSC22D3Q99576 134 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TMBIM4Q9HC24 238 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 NVLO15381 856 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 GH1P01241 217 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 SPDYE6P0CI01 402 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 STX3Q13277 289 aa18.48■□□□□ 0.55
SCARB2-201ENST00000264896 TMTC4Q5T4D3 741 aa18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms