RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262305.8

RAB11FIP3-201, Transcript of RAB11 family interacting protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11FIP3, Length 4,831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CST8O60676 142 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ITGB3P05106 788 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GPD1P21695 349 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GRIK1P39086 918 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GRAP2O75791 330 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RPSAP08865 295 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RBP3P10745 1247 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RHBDL3P58872 404 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CCNYL1Q8N7R7 359 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RAPGEF5Q92565 580 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZSWIM1Q9BR11 485 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GTF2A2P52657 109 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RASSF3Q86WH2 238 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 AP3B1O00203 1094 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SKIP12755 728 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PNPLA4P41247 253 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SLC26A2P50443 739 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 A0A087X0B3 334 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM86B1E9PN63 330 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 WNT10BO00744 389 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SGPL1O95470 568 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GNASQ5JWF2 1037 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ATP9BO43861 1147 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NPTXRO95502 500 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SPATA18Q8TC71 538 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MRIQ9BWK5 157 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PAK5Q9P286 719 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SUN2Q9UH99 717 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DFFAO00273 331 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MAPTP10636 758 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CPT1AP50416 773 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 POU5F1BQ06416 359 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 AGBL2Q5U5Z8 902 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DNERQ8NFT8 737 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PLSCR1O15162 318 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FNTAP49354 379 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF235Q14590 738 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SEZ6Q53EL9 994 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CYP11B1P15538 503 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DSG3P32926 999 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 COILP38432 576 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 DEUP1Q05D60 604 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PGM5Q15124 567 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 UBA3Q8TBC4 463 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZNF507Q8TCN5 953 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RARRES1P49788 294 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CLCN3P51790 818 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 F8VZ95 297 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 HERVK_113P62684 666 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PDZD8Q8NEN9 1154 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 KIF3CO14782 793 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TAF6P49848 677 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 RASIP1Q5U651 963 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CD302Q8IX05 232 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRIM33Q9UPN9 1127 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 SNX2O60749 519 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 BOLA3Q53S33 107 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 GLB1LQ6UWU2 654 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 CGRRF1Q99675 332 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 FAM129AQ9BZQ8 928 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP3-201ENST00000262305 TRPV6Q9H1D0 765 aa22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms