RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.81■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CFAP99D6REC4 459 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SNX19Q92543 992 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TMEM245Q9H330 911 aa16.81■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 POTEFA5A3E0 1075 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MFN2O95140 757 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ABL1P00519 1130 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 POTEIP0CG38 1075 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CDH6P55285 790 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ABCB5Q2M3G0 1257 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 POTEGQ6S5H5 508 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 POTEEQ6S8J3 1075 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SULF1Q8IWU6 871 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TNIP2Q8NFZ5 429 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ABCF3Q9NUQ8 709 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FAM205CA6NFA0 338 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 XPOTO43592 962 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CTDNEP1O95476 244 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 GSNP06396 782 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZNF667Q5HYK9 610 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 BARHL2Q9NY43 387 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FAM153BP0C7A2 387 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 KCNA2P16389 499 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FAM153CQ494X1 144 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 C18orf8Q96DM3 657 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TBX22Q9Y458 520 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ATP10AO60312 1499 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TPST1O60507 370 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 AKR1B1P15121 316 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 P3H2Q8IVL5 708 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FSD1LQ9BXM9 530 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 WHRNQ9P202 907 aa16.8■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 APRTP07741 180 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SDC4P31431 198 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TMEM117Q9H0C3 514 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SLC9A1P19634 815 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ATP6V1C1P21283 382 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 STX5Q13190 355 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 LAYNQ6UX15 382 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 CEP95Q96GE4 821 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TAF4O00268 1085 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 KCNN4O15554 427 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PSMG1O95456 288 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 EPHA10Q5JZY3 1008 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SYCP2LQ5T4T6 812 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PHF20Q9BVI0 1012 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PYGLP06737 847 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 KRT76Q01546 638 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB39O15060 712 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 STX19Q8N4C7 294 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ULK4Q96C45 1275 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 KAT6BQ8WYB5 2073 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 K7ERI5 159 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 NDNQ99608 321 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 EFCAB1Q9HAE3 211 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 TMEM260Q9NX78 707 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 APOL1O14791 398 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 AQP5P55064 265 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FIGNQ5HY92 759 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 PADI6Q6TGC4 694 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZNF554Q86TJ5 538 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 SIX5Q8N196 739 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 FAM20AQ96MK3 541 aa16.78■□□□□ 0.28
CTIF-201ENST00000256413 GDF3Q9NR23 364 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms