RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SENP8Q96LD8 212 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 GBP4Q96PP9 640 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CD207Q9UJ71 328 aa24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 MBTPS2O43462 519 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TGM5O43548 720 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 AKAP3O75969 853 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ITGB3P05106 788 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TJAP1Q5JTD0 557 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 PDXDC1Q6P996 788 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CGRRF1Q99675 332 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.07■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 BIN1O00499 593 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 OAZ2O95190 189 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31D3P0C874 917 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 DLATP10515 647 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 IL9P15248 144 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 NR2F2P24468 414 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CREMQ03060 361 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 DUOXA2Q1HG44 320 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 C1orf220Q5T0J3 134 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD40Q6AI12 368 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 GPT2Q8TD30 523 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CLSTN2Q9H4D0 955 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ITGA11Q9UKX5 1188 aa24.06■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 GLUD1P00367 558 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TMEM191BP0C7N4 346 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 PAX3P23760 479 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 OR1D2P34982 312 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TAF6P49848 677 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 DLG4P78352 724 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ADAM9Q13443 819 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 RAB33AQ14088 237 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 APPL2Q8NEU8 664 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 SUSD6Q92537 303 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CDH22Q9UJ99 828 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.05■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 KPNA7A9QM74 516 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 MAPK13O15264 365 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 PAPLNO95428 1278 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CYP11A1P05108 521 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TNNI1P19237 187 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TYMPP19971 482 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CEP135Q66GS9 1140 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 EEF2KMTQ96G04 330 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 FNBP1Q96RU3 617 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 APOL5Q9BWW9 433 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.04■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 RBP5P82980 135 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TMC2Q8TDI7 906 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 DZANK1Q9NVP4 752 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TSC2P49815 1807 aa24.03■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CYB561D2O14569 222 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ABLIM3O94929 683 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 TNNC2P02585 160 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 SRGAP2BP0DMP2 458 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 CCNE1P24864 410 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
SYF2-201ENST00000236273 WDR27A2RRH5 827 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 H7C4K7 107 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 KRT19P08727 400 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 RPL13P26373 211 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 PNPLA4P41247 253 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 ROR1Q01973 937 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 SV2CQ496J9 727 aa24.01■■□□□ 1.43
SYF2-201ENST00000236273 CTXN3Q4LDR2 81 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms