RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 CYP4A11Q02928 519 aa22.45■■□□□ 1.19
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ODC1-201ENST00000234111 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.45■■□□□ 1.19
ODC1-201ENST00000234111 ACAD11Q709F0 780 aa22.45■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 TRIM42Q8IWZ5 723 aa22.45■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ARHGAP24Q8N264 748 aa22.45■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 LMO3Q8TAP4 145 aa22.45■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.45■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 KCNK13Q9HB14 408 aa22.45■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 H3BRJ5 948 aa22.44■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 KAT5Q92993 513 aa22.44■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 MAP3K10Q02779 954 aa22.44■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 USP17L11C9JVI0 530 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 USP17L18D6R9N7 530 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 USP17L22D6RA61 530 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 USP17L19D6RCP7 530 aa22.43■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 ZNF862O60290 1169 aa22.43■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 USP17L24Q0WX57 530 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 KRT72Q14CN4 511 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 EPS8L1Q8TE68 723 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 MANSC1Q9H8J5 431 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.43■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 BBOF1Q8ND07 529 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.43■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.43■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ABCA3Q99758 1704 aa22.42■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 BUD23O43709 281 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 PIAS1O75925 651 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 RASSF3Q86WH2 238 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.42■■□□□ 1.184e-10■■■■■ 27.9
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ODC1-201ENST00000234111 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 SLC17A7Q9P2U7 560 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 GOLGA8RI6L899 631 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 SCUBE1Q8IWY4 988 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.42■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
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ODC1-201ENST00000234111 PIK3CDO00329 1044 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 RPA1P27694 616 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 CCDC174Q6PII3 467 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 MYCT1Q8N699 235 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.185e-8■■■□□ 15.3
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ODC1-201ENST00000234111 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 GTF3C4Q9UKN8 822 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 PGM3O95394 542 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ENO1P06733 434 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ABCD1P33897 745 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ARL4CP56559 192 aa22.41■■□□□ 1.18
ODC1-201ENST00000234111 ACTR3P61158 418 aa22.41■■□□□ 1.18
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