RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 EFEMP2O95967 443 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 RAP1GAPP47736 663 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF699Q32M78 642 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM175Q9BSA9 504 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 GANQ9H2C0 597 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 NME7Q9Y5B8 376 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa21.49■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 REV3LO60673 3130 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 HCRTO43612 131 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 ASPAP45381 313 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 TAP1Q03518 808 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 RRAGAQ7L523 313 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 UROC1Q96N76 676 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 TRIM5Q9C035 493 aa21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 ALDH2P05091 517 aa21.47■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 CDH8P55286 799 aa21.47■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.47■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 FKBP15Q5T1M5 1219 aa21.47■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 KPNA7A9QM74 516 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 TAF6P49848 677 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 FILIP1LQ4L180 1135 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 GPIHBP1Q8IV16 184 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 IGSF21Q96ID5 467 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 SENP8Q96LD8 212 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF558Q96NG5 402 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 CERS4Q9HA82 394 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 SNX9Q9Y5X1 595 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 FHOD1Q9Y613 1164 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 TPM2P07951 284 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 LAG3P18627 525 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 SOWAHAQ2M3V2 549 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 IQCEQ6IPM2 695 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 L1RE1Q9UN81 338 aa21.46■■□□□ 1.03
KDELR3-201ENST00000216014 ADCY5O95622 1261 aa21.45■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 WEE2P0C1S8 567 aa21.45■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 OSTM1Q86WC4 334 aa21.45■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.45■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 MYO7AQ13402 2215 aa21.45■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 EPOPA6NHQ4 379 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 DNAJB1P25685 340 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ATICP31939 592 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CTNNB1P35222 781 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 BMPR1AP36894 532 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 FUT10Q6P4F1 479 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 VSTM4Q8IW00 320 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF560Q96MR9 790 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 GPR88Q9GZN0 384 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.44■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 A0A1W2PQC6 194 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 M0QZQ0 153 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CYB561D2O14569 222 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 TADA2AO75478 443 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CALCAP01258 141 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 DNAJB2P25686 324 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 CCDC142Q17RM4 750 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 SV2CQ496J9 727 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.43■■□□□ 1.02
KDELR3-201ENST00000216014 WSCD1Q658N2 575 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms