RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ITSN1Q15811 1721 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PGK2P07205 417 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 BMP3P12645 472 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 RERGLQ9H628 205 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 MANSC1Q9H8J5 431 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.69□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 B2RBV5 119 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CHRNDQ07001 517 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 FAM167AQ96KS9 214 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 TBKBP1A7MCY6 615 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ZNF23P17027 643 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 HIST1H2ADP20671 130 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 VAMP7P51809 220 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 RPS7P62081 194 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PRKCQQ04759 706 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 C1DQ13901 141 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 TRIM65Q6PJ69 517 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 KDELC2Q7Z4H8 507 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 COA7Q96BR5 231 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ECSITQ9BQ95 431 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 NOD2Q9HC29 1040 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CYP2C19P33261 490 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ZNF862O60290 1169 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 AMACRQ9UHK6 382 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 E7ENQ6 273 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 DPYSL4O14531 572 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ZBTB39O15060 712 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PRCPP42785 496 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CDK17Q00537 523 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 KLHL11Q9NVR0 708 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 NDUFA13Q9P0J0 144 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CENPXA8MT69 81 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 RGS20O76081 388 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 MS4A14Q96JA4 679 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 STK39Q9UEW8 545 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 TMEM120BA0PK00 339 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 GNAT1P11488 350 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 RESTQ13127 1097 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 RIC8BQ9NVN3 520 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 TEX28O15482 410 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 LCP1P13796 627 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 SLC1A1P43005 524 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PHKA1P46020 1223 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 MAPKAPK2P49137 400 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PRIM2P49643 509 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 KRT74Q7RTS7 529 aa9.68□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 TRIM43BA6NCK2 446 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 IL13P35225 146 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 MICALL2Q8IY33 904 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 SIK2Q9H0K1 926 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PIGUQ9H490 435 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 E2F8A0AVK6 867 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CLPTM1O96005 669 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CORO7P57737 925 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 MAPK6Q16659 721 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 UBE2SQ16763 222 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 KRT35Q92764 455 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 LGR6Q9HBX8 967 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 FAM25AB3EWG3 89 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 FAM25CB3EWG5 89 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 FAM25GB3EWG6 89 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PIK3R1P27986 724 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 JADE3Q92613 823 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 PLIN5Q00G26 463 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CUL4AQ13619 759 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 C4orf33Q8N1A6 199 aa9.67□□□□□ -0.86
TNS1-201ENST00000171887 STKLD1Q8NE28 680 aa9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms