RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMC1P11047 1609 aa35.15■■■■□ 3.22
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-215ENST00000628018 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.13■■■■□ 3.21
CAPNS1-215ENST00000628018 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-215ENST00000628018 USP47Q96K76 1375 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-215ENST00000628018 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-215ENST00000628018 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-215ENST00000628018 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-215ENST00000628018 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFYVE9O95405 1425 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-215ENST00000628018 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3C2GO75747 1445 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-215ENST00000628018 VGFO15240 615 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRP1Q9C000 1473 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-215ENST00000628018 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-215ENST00000628018 IQGAP1P46940 1657 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-215ENST00000628018 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-215ENST00000628018 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-215ENST00000628018 RIMS2Q9UQ26 1411 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-215ENST00000628018 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-215ENST00000628018 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-215ENST00000628018 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-215ENST00000628018 WASHC2AQ641Q2 1341 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO3AQ8NEV4 1616 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ADGRB1O14514 1584 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC7Q96M83 1385 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-215ENST00000628018 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-215ENST00000628018 HDGFP51858 240 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRMP28827 1452 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.16
CAPNS1-215ENST00000628018 ALKQ9UM73 1620 aa34.76■■■■□ 3.16
CAPNS1-215ENST00000628018 TESK2Q96S53 571 aa34.76■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SLIT1O75093 1534 aa34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM132EQ6IEE7 984 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-215ENST00000628018 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-215ENST00000628018 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-215ENST00000628018 LTKP29376 864 aa34.65■■■■□ 3.14
CAPNS1-215ENST00000628018 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.64■■■■□ 3.14
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 EID1Q9Y6B2 187 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 TMF1P82094 1093 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 MIER1Q8N108 512 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC24A1O60721 1099 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-215ENST00000628018 POLR3GLQ9BT43 218 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-215ENST00000628018 QRICH2Q9H0J4 1663 aa34.54■■■■□ 3.12
CAPNS1-215ENST00000628018 MED14O60244 1454 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-215ENST00000628018 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-215ENST00000628018 STK26Q9P289 416 aa34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-215ENST00000628018 METP08581 1390 aa34.51■■■■□ 3.11
CAPNS1-215ENST00000628018 BCANQ96GW7 911 aa34.5■■■■□ 3.11
CAPNS1-215ENST00000628018 DLC1Q96QB1 1528 aa34.49■■■■□ 3.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.48■■■■□ 3.11
CAPNS1-215ENST00000628018 CDCA8Q53HL2 280 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCC11Q96J66 1382 aa34.47■■■■□ 3.11
CAPNS1-215ENST00000628018 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-215ENST00000628018 DIP2AQ14689 1571 aa34.43■■■■□ 3.1
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.42■■■■□ 3.1
CAPNS1-215ENST00000628018 TBX22Q9Y458 520 aa34.4■■■■□ 3.1
CAPNS1-215ENST00000628018 TECPR2O15040 1411 aa34.4■■■■□ 3.1
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAM1Q96QH2 718 aa34.39■■■■□ 3.1
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A8Q96RN1 970 aa34.38■■■■□ 3.09
CAPNS1-215ENST00000628018 ANP32CO43423 234 aa34.37■■■■□ 3.09
CAPNS1-215ENST00000628018 CPS1P31327 1500 aa34.36■■■■□ 3.09
CAPNS1-215ENST00000628018 SIRT1Q96EB6 747 aa34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-215ENST00000628018 POGKQ9P215 609 aa34.35■■■■□ 3.09
CAPNS1-215ENST00000628018 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.34■■■■□ 3.09
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM135BQ49AJ0 1406 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-215ENST00000628018 MYOM1P52179 1685 aa34.33■■■■□ 3.09
CAPNS1-215ENST00000628018 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.32■■■■□ 3.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRUQ92729 1446 aa34.31■■■■□ 3.08
CAPNS1-215ENST00000628018 EVC2Q86UK5 1308 aa34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.29■■■■□ 3.08
CAPNS1-215ENST00000628018 WAPLQ7Z5K2 1190 aa34.28■■■■□ 3.08
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3R4Q99570 1358 aa34.26■■■■□ 3.07
CAPNS1-215ENST00000628018 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
CAPNS1-215ENST00000628018 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.24■■■■□ 3.07
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