RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627074.2

PCBP1-AS1-308, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 871 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KANK1	Q14678	1352 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IQGAP1	P46940	1657 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ITGAE	P38570	1179 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		11.69	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PKD2	Q13563	968 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CERK	Q8TCT0	537 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NOS1	P29475	1434 aa		11.68	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	FBXO41	Q8TF61	875 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MED14	O60244	1454 aa		11.67	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		11.66	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLIT1	O75093	1534 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ADGRB3	O60242	1522 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NAIP	Q13075	1403 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IDI1	Q13907	227 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NUP155	O75694	1391 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LTK	P29376	864 aa		11.6	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HFM1	A2PYH4	1435 aa		11.59	□□□□□ -0.55
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CPS1	P31327	1500 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ABCB7	O75027	752 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CLTCL1	P53675	1640 aa		11.57	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZFYVE9	O95405	1425 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ALK	Q9UM73	1620 aa		11.56	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KIF1B	O60333	1816 aa		11.55	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	11.54	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TRPM2	O94759	1503 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		11.53	□□□□□ -0.56
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		11.52	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	EID1	Q9Y6B2	187 aa		11.51	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		11.48	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PPL	O60437	1756 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TRIM52	Q96A61	297 aa		11.47	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	IFT172	Q9UG01	1749 aa		11.46	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DIP2A	Q14689	1571 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		11.45	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KLHL34	Q8N239	644 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPOCK2	Q92563	424 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	KCNA6	P17658	529 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TBX22	Q9Y458	520 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PTPRU	Q92729	1446 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TMEM94	Q12767	1356 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	DSG3	P32926	999 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PIP4K2B	P78356	416 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	BCAN	Q96GW7	911 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	TOM1	O60784	492 aa		11.39	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		11.38	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	HSPA1L	P34931	641 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	11.37	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	SSUH2	Q9Y2M2	353 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	MET	P08581	1390 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PIK3R4	Q99570	1358 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		11.37	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		11.35	□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		11.33	□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-308	ENST00000627074	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		11.32	□□□□□ -0.6

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