RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623635.1

PTPRQ-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-210ENST00000623635 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PTPRQ-210ENST00000623635 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRQ-210ENST00000623635 MAP2K5Q13163 448 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRQ-210ENST00000623635 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
PTPRQ-210ENST00000623635 IRF6O14896 467 aa13.71□□□□□ -0.21
PTPRQ-210ENST00000623635 SLF2Q8IX21 1173 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRQ-210ENST00000623635 APLP1P51693 650 aa13.69□□□□□ -0.22
PTPRQ-210ENST00000623635 ZMYND10O75800 440 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRQ-210ENST00000623635 CCDC102AQ96A19 550 aa13.68□□□□□ -0.22
PTPRQ-210ENST00000623635 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
PTPRQ-210ENST00000623635 NYAP1Q6ZVC0 841 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC10A3P09131 477 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRQ-210ENST00000623635 BARGINQ6ZT62 677 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRQ-210ENST00000623635 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRQ-210ENST00000623635 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC4A3P48751 1232 aa13.61□□□□□ -0.23
PTPRQ-210ENST00000623635 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PTPRQ-210ENST00000623635 CFHP08603 1231 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRQ-210ENST00000623635 TJAP1Q5JTD0 557 aa13.59□□□□□ -0.23
PTPRQ-210ENST00000623635 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 MTRQ99707 1265 aa13.58□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 NECTIN2Q92692 538 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 COPS2P61201 443 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 RDH13Q8NBN7 331 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 ZNF516Q92618 1163 aa13.55□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 KCNC4Q03721 635 aa13.54□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 IFFO2Q5TF58 517 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRQ-210ENST00000623635 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa13.51□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 IL21Q9HBE4 155 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 NKX2-3Q8TAU0 364 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 TMUB1Q9BVT8 246 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC24A3Q9HC58 644 aa13.49□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 PRR14Q9BWN1 585 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 RSPH4AQ5TD94 716 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 SULF1Q8IWU6 871 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.47□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 A0A0G2JS52 829 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 CD46P15529 392 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 GCGRP47871 477 aa13.46□□□□□ -0.25
PTPRQ-210ENST00000623635 TRIM66O15016 1216 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 CLCN1P35523 988 aa13.45□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 FUT2Q10981 343 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 AK7Q96M32 723 aa13.44□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 ZPR1O75312 459 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 AMHR2Q16671 573 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 TLL1O43897 1013 aa13.42□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
PTPRQ-210ENST00000623635 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 PARP9Q8IXQ6 854 aa13.38□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 MORN1Q5T089 497 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 SCUBE3Q8IX30 993 aa13.37□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 RGS20O76081 388 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 ATP6V1AP38606 617 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 PPP1R18Q6NYC8 613 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 HLA-CQ95604 372 aa13.35□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 NR1I2O75469 434 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 PDE4DQ08499 809 aa13.34□□□□□ -0.27
PTPRQ-210ENST00000623635 KDM4AO75164 1064 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa13.33□□□□□ -0.28
PTPRQ-210ENST00000623635 MS4A1P11836 297 aa13.31□□□□□ -0.28
PTPRQ-210ENST00000623635 GUCA2AQ02747 115 aa13.29□□□□□ -0.28
PTPRQ-210ENST00000623635 THAP11Q96EK4 314 aa13.28□□□□□ -0.28
PTPRQ-210ENST00000623635 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PTPRQ-210ENST00000623635 S1PR4O95977 384 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 ADH1BP00325 375 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa13.27□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 HOXA2O43364 376 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 SPSB2Q99619 263 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.26□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 SPIRE2Q8WWL2 714 aa13.25□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 GRIPAP1Q4V328 841 aa13.24□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 RNF223E7ERA6 249 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 USP46P62068 366 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 BRICD5Q6PL45 260 aa13.23□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 NDUFV2P19404 249 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC6A16Q9GZN6 736 aa13.21□□□□□ -0.29
PTPRQ-210ENST00000623635 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 PRDM9Q9NQV7 894 aa13.2□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 MOXD2PA6NHM9 499 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 TMEM132AQ24JP5 1023 aa13.19□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 GGCXP38435 758 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 PCDHGC3Q9UN70 934 aa13.18□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 TBC1D2Q9BYX2 928 aa13.17□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 FDX1P10109 184 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms