RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 MADDQ8WXG6 1647 aa7.49□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.49□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 PPLO60437 1756 aa7.49□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.49□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 MYO5BQ9ULV0 1848 aa7.49□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 USP47Q96K76 1375 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 C3P01024 1663 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 ZFYVE9O95405 1425 aa7.48□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 PLPPR3Q6T4P5 718 aa7.48□□□□□ -1.21
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CCL23-202ENST00000613876 A2ML1A8K2U0 1454 aa7.48□□□□□ -1.21
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CCL23-202ENST00000613876 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.47□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.47□□□□□ -1.21
CCL23-202ENST00000613876 LAMC1P11047 1609 aa7.46□□□□□ -1.21
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CCL23-202ENST00000613876 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.46□□□□□ -1.22
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CCL23-202ENST00000613876 RIMS2Q9UQ26 1411 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 NLRP1Q9C000 1473 aa7.45□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 KIF7Q2M1P5 1343 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 CCDC7Q96M83 1385 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.44□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 TESK2Q96S53 571 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 TMEM2Q9UHN6 1383 aa7.43□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 IQGAP1P46940 1657 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 LTKP29376 864 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 MIER1Q8N108 512 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 ADGRB1O14514 1584 aa7.42□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 ALKQ9UM73 1620 aa7.41□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 TMF1P82094 1093 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 EID1Q9Y6B2 187 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 PTPRMP28827 1452 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 ARHGAP23Q9P227 1491 aa7.4□□□□□ -1.22
CCL23-202ENST00000613876 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 SLIT1O75093 1534 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 SLC24A1O60721 1099 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 BCANQ96GW7 911 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 POLR3GLQ9BT43 218 aa7.39□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 STK26Q9P289 416 aa7.39□□□□□ -1.23
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CCL23-202ENST00000613876 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa7.38□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 CDCA8Q53HL2 280 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 TBX22Q9Y458 520 aa7.37□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 MED14O60244 1454 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 METP08581 1390 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 ABCC11Q96J66 1382 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 ANKLE2Q86XL3 938 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 SIRT1Q96EB6 747 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 SLC26A8Q96RN1 970 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 ANP32CO43423 234 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 PRAM1Q96QH2 718 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 POGKQ9P215 609 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 DLC1Q96QB1 1528 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.34□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 QRICH2Q9H0J4 1663 aa7.34□□□□□ -1.23
CCL23-202ENST00000613876 EVC2Q86UK5 1308 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 PANK3Q9H999 370 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 PTPRUQ92729 1446 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa7.33□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 TECPR2O15040 1411 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 FAM135BQ49AJ0 1406 aa7.32□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 CCER2I3L3R5 266 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 DIP2AQ14689 1571 aa7.31□□□□□ -1.24
CCL23-202ENST00000613876 KNDC1Q76NI1 1749 aa7.31□□□□□ -1.24
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