RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603949.1

SMC2-AS1-202, Transcript of SMC2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

Gene SMC2-AS1, Length 672 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NOS1P29475 1434 aa14.86□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 GGT6Q6P531 493 aa14.86□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.86□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PIK3C2BO00750 1634 aa14.85□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MROH2AA6NES4 1674 aa14.85□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TMF1P82094 1093 aa14.85□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CDCA8Q53HL2 280 aa14.85□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.84□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.84□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TSPOAP1O95153 1857 aa14.84□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.83□□□□□ -0.03
SMC2-AS1-202ENST00000603949 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.83□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.83□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PPLO60437 1756 aa14.83□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.81□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.81□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.8□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.8□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SYNMO15061 1565 aa14.79□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 RALBP1Q15311 655 aa14.79□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.79□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TESK2Q96S53 571 aa14.79□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.78□□□□□ -0.04
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MRS2Q9HD23 443 aa14.77□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PIK3C2GO75747 1445 aa14.76□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ZFYVE9O95405 1425 aa14.75□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.75□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.74□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.73□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CHGAP10645 457 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.71□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ERVK-7P63135 1459 aa14.71□□□□□ -0.05
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.7□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.7□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PARD3Q8TEW0 1356 aa14.7□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.69□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ADGRB1O14514 1584 aa14.68□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.67□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NLRP13Q86W25 1043 aa14.66□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TMC1Q8TDI8 760 aa14.66□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MYOM1P52179 1685 aa14.65□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.65□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 INSRP06213 1382 aa14.65□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.65□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.65□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.65□□□□□ -0.06
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NEFLP07196 543 aa14.64□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 IDI1Q13907 227 aa14.64□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PANK3Q9H999 370 aa14.64□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.63□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.63□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CCDC184Q52MB2 194 aa14.62□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.62□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.62□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 STAG3Q9UJ98 1225 aa14.6□□□□□ -0.07
SMC2-AS1-202ENST00000603949 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.57□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.57□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 USP32Q8NFA0 1604 aa14.56□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.55□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 EVC2Q86UK5 1308 aa14.55□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ZMYM3Q14202 1370 aa14.55□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 DLC1Q96QB1 1528 aa14.54□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ALKQ9UM73 1620 aa14.54□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 RIMS2Q9UQ26 1411 aa14.53□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.53□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NLRP1Q9C000 1473 aa14.51□□□□□ -0.09
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TNRQ92752 1358 aa14.51□□□□□ -0.09
SMC2-AS1-202ENST00000603949 MLECQ14165 292 aa14.51□□□□□ -0.09
SMC2-AS1-202ENST00000603949 NSD2O96028 1365 aa14.5□□□□□ -0.09
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TMEM132EQ6IEE7 984 aa14.5□□□□□ -0.09
SMC2-AS1-202ENST00000603949 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.5□□□□□ -0.09
SMC2-AS1-202ENST00000603949 PTPRMP28827 1452 aa14.5□□□□□ -0.09
SMC2-AS1-202ENST00000603949 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms