RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 EID1Q9Y6B2 187 aa12.25□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa12.25□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.25□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.24□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa12.23□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.23□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.23□□□□□ -0.45
ZNF548-208ENST00000597576 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.2□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.2□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 ADGRB3O60242 1522 aa12.18□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 APLP2Q06481 763 aa12.18□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 BRINP3Q76B58 766 aa12.18□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC125Q86Z20 511 aa12.18□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 BCL9LQ86UU0 1499 aa12.18□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.17□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 BRWD3Q6RI45 1802 aa12.17□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 C8orf37Q96NL8 207 aa12.17□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.17□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 UTRNP46939 3433 aa12.16□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 LAMC1P11047 1609 aa12.16□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 NGLY1Q96IV0 654 aa12.16□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 ATRNO75882 1429 aa12.16□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 ZFYVE9O95405 1425 aa12.15□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 CEP350Q5VT06 3117 aa12.15□□□□□ -0.46
ZNF548-208ENST00000597576 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.14□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.14□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa12.14□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.13□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 DCCP43146 1447 aa12.12□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 IDI1Q13907 227 aa12.12□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 IFFO2Q5TF58 517 aa12.12□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 C19orf44Q9H6X5 657 aa12.12□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.12□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 MST1RQ04912 1400 aa12.11□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.11□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 UNC13BO14795 1591 aa12.11□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.1□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.1□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 NOS1P29475 1434 aa12.1□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.1□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
ZNF548-208ENST00000597576 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.08□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 ATF3P18847 181 aa12.08□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 HRCP23327 699 aa12.08□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 TRPM2O94759 1503 aa12.07□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 GLI3P10071 1580 aa12.07□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 DEFB132Q7Z7B7 95 aa12.07□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 USP21Q9UK80 565 aa12.07□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 PTCH1Q13635 1447 aa12.06□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 STAG3Q9UJ98 1225 aa12.06□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 TBX22Q9Y458 520 aa12.06□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 ADAMTS2O95450 1211 aa12.05□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.05□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 NALCNQ8IZF0 1738 aa12.05□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 PIK3R4Q99570 1358 aa12.05□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 PTPRUQ92729 1446 aa12.04□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 TSPY4P0CV99 314 aa12.04□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 TSPY10P0CW01 314 aa12.04□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 ERBINQ96RT1 1412 aa12.03□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 YY1P25490 414 aa12.03□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 C14orf37Q86TY3 774 aa12.03□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa12.03□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.03□□□□□ -0.48
ZNF548-208ENST00000597576 MYOM2P54296 1465 aa12.02□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 BCANQ96GW7 911 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 RALGAPBQ86X10 1494 aa11.99□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.98□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 KIF15Q9NS87 1388 aa11.97□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 RGPD1P0DJD0 1748 aa11.97□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-208ENST00000597576 PTPN23Q9H3S7 1636 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 SLIT2O94813 1529 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa11.94□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 KANK1Q14678 1352 aa11.92□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 CHD4Q14839 1912 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.91□□□□□ -0.5
ZNF548-208ENST00000597576 PXDNQ92626 1479 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms