RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 SYNMO15061 1565 aa18.96■□□□□ 0.63
FCHO1-221ENST00000597512 NRXN1Q9ULB1 1477 aa18.96■□□□□ 0.63
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FCHO1-221ENST00000597512 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
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FCHO1-221ENST00000597512 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.93■□□□□ 0.62
FCHO1-221ENST00000597512 TMF1P82094 1093 aa18.93■□□□□ 0.62
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FCHO1-221ENST00000597512 CCDC184Q52MB2 194 aa18.9■□□□□ 0.62
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FCHO1-221ENST00000597512 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.9■□□□□ 0.62
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FCHO1-221ENST00000597512 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.89■□□□□ 0.61
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FCHO1-221ENST00000597512 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
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FCHO1-221ENST00000597512 MYO5BQ9ULV0 1848 aa18.83■□□□□ 0.61
FCHO1-221ENST00000597512 CDCA8Q53HL2 280 aa18.83■□□□□ 0.61
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FCHO1-221ENST00000597512 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa18.66■□□□□ 0.58
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FCHO1-221ENST00000597512 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.65■□□□□ 0.58
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FCHO1-221ENST00000597512 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.62■□□□□ 0.57
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FCHO1-221ENST00000597512 PTPRMP28827 1452 aa18.56■□□□□ 0.56
FCHO1-221ENST00000597512 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
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FCHO1-221ENST00000597512 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.5■□□□□ 0.55
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FCHO1-221ENST00000597512 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 DLC1Q96QB1 1528 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 PRAM1Q96QH2 718 aa18.5■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 POGKQ9P215 609 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 C3P01024 1663 aa18.49■□□□□ 0.55
FCHO1-221ENST00000597512 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
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