RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-211ENST00000568829 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS1-211ENST00000568829 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-211ENST00000568829 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
SPNS1-211ENST00000568829 ZFYVE9O95405 1425 aa25.1■■□□□ 1.61
SPNS1-211ENST00000568829 E9PCH4 1651 aa25.09■■□□□ 1.61
SPNS1-211ENST00000568829 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.08■■□□□ 1.6
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM94Q12767 1356 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS1-211ENST00000568829 TBX22Q9Y458 520 aa25.07■■□□□ 1.6
SPNS1-211ENST00000568829 ILDR2Q71H61 639 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-211ENST00000568829 ALKQ9UM73 1620 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-211ENST00000568829 MSH6P52701 1360 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS1-211ENST00000568829 SOCS7O14512 581 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 PIK3R4Q99570 1358 aa25.01■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 NWD1Q149M9 1564 aa25■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 NAIPQ13075 1403 aa24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 DIP2AQ14689 1571 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 TRIM52Q96A61 297 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.97■■□□□ 1.59
SPNS1-211ENST00000568829 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 C14orf37Q86TY3 774 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 HFM1A2PYH4 1435 aa24.95■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.93■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.91■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 SLAIN2Q9P270 581 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 TRPM2O94759 1503 aa24.9■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
SPNS1-211ENST00000568829 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SPNS1-211ENST00000568829 CADPS2Q86UW7 1296 aa24.88■■□□□ 1.57
SPNS1-211ENST00000568829 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-211ENST00000568829 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.87■■□□□ 1.57
SPNS1-211ENST00000568829 ATF3P18847 181 aa24.86■■□□□ 1.57
SPNS1-211ENST00000568829 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SPNS1-211ENST00000568829 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS1-211ENST00000568829 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS1-211ENST00000568829 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.81■■□□□ 1.56
SPNS1-211ENST00000568829 CLTCL1P53675 1640 aa24.79■■□□□ 1.56
SPNS1-211ENST00000568829 KIF1BO60333 1816 aa24.77■■□□□ 1.56
SPNS1-211ENST00000568829 DCCP43146 1447 aa24.75■■□□□ 1.55
SPNS1-211ENST00000568829 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.74■■□□□ 1.55
SPNS1-211ENST00000568829 PTPRUQ92729 1446 aa24.73■■□□□ 1.55
SPNS1-211ENST00000568829 JCADQ9P266 1359 aa24.73■■□□□ 1.55
SPNS1-211ENST00000568829 METP08581 1390 aa24.7■■□□□ 1.55
SPNS1-211ENST00000568829 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.7■■□□□ 1.54
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-211ENST00000568829 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
SPNS1-211ENST00000568829 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-211ENST00000568829 PHLPP1O60346 1717 aa24.68■■□□□ 1.54
SPNS1-211ENST00000568829 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SPNS1-211ENST00000568829 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa24.64■■□□□ 1.54
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 BRINP3Q76B58 766 aa24.62■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 PTCH1Q13635 1447 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 FOXD1Q16676 465 aa24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.6■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 RGL3Q3MIN7 710 aa24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
SPNS1-211ENST00000568829 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-211ENST00000568829 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-211ENST00000568829 MST1RQ04912 1400 aa24.57■■□□□ 1.52
SPNS1-211ENST00000568829 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SPNS1-211ENST00000568829 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-211ENST00000568829 PPLO60437 1756 aa24.54■■□□□ 1.52
SPNS1-211ENST00000568829 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.53■■□□□ 1.52
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SPNS1-211ENST00000568829 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.51■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.49■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 POTEAQ6S8J7 498 aa24.48■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 SHPRHQ149N8 1683 aa24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.46■■□□□ 1.51
SPNS1-211ENST00000568829 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 STK26Q9P289 416 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 NHSL1Q5SYE7 1610 aa24.43■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 HRCP23327 699 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 PIK3C2GO75747 1445 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 ABCC11Q96J66 1382 aa24.42■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 TECPR2O15040 1411 aa24.41■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 LRP6O75581 1613 aa24.39■■□□□ 1.5
SPNS1-211ENST00000568829 SIRT1Q96EB6 747 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 ORAI2Q96SN7 254 aa24.38■■□□□ 1.49
SPNS1-211ENST00000568829 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.37■■□□□ 1.49
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