RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.46■■□□□ 1.83
INO80E-211ENST00000567987 LAMC1P11047 1609 aa26.45■■□□□ 1.83
INO80E-211ENST00000567987 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa26.45■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.45■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 TNRQ92752 1358 aa26.43■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.42■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.42■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.41■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 C3P01024 1663 aa26.41■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.41■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 MIER1Q8N108 512 aa26.39■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 PIK3C2GO75747 1445 aa26.39■■□□□ 1.82
INO80E-211ENST00000567987 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.38■■□□□ 1.81
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INO80E-211ENST00000567987 CCDC7Q96M83 1385 aa26.35■■□□□ 1.81
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INO80E-211ENST00000567987 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
INO80E-211ENST00000567987 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.33■■□□□ 1.81
INO80E-211ENST00000567987 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
INO80E-211ENST00000567987 IQGAP1P46940 1657 aa26.33■■□□□ 1.81
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INO80E-211ENST00000567987 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
INO80E-211ENST00000567987 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.3■■□□□ 1.8
INO80E-211ENST00000567987 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.28■■□□□ 1.8
INO80E-211ENST00000567987 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
INO80E-211ENST00000567987 NLRP1Q9C000 1473 aa26.28■■□□□ 1.8
INO80E-211ENST00000567987 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.28■■□□□ 1.8
INO80E-211ENST00000567987 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.27■■□□□ 1.8
INO80E-211ENST00000567987 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
INO80E-211ENST00000567987 TESK2Q96S53 571 aa26.25■■□□□ 1.79
INO80E-211ENST00000567987 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.24■■□□□ 1.79
INO80E-211ENST00000567987 ADGRB1O14514 1584 aa26.24■■□□□ 1.79
INO80E-211ENST00000567987 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.23■■□□□ 1.79
INO80E-211ENST00000567987 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
INO80E-211ENST00000567987 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.2■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.19■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.17■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.17■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.16■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 ALKQ9UM73 1620 aa26.16■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 TMF1P82094 1093 aa26.15■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.14■■□□□ 1.78
INO80E-211ENST00000567987 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
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INO80E-211ENST00000567987 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
INO80E-211ENST00000567987 STK26Q9P289 416 aa26.08■■□□□ 1.77
INO80E-211ENST00000567987 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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INO80E-211ENST00000567987 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
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INO80E-211ENST00000567987 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
INO80E-211ENST00000567987 BCANQ96GW7 911 aa26.06■■□□□ 1.76
INO80E-211ENST00000567987 EID1Q9Y6B2 187 aa26.05■■□□□ 1.76
INO80E-211ENST00000567987 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
INO80E-211ENST00000567987 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.04■■□□□ 1.76
INO80E-211ENST00000567987 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.03■■□□□ 1.76
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INO80E-211ENST00000567987 CDCA8Q53HL2 280 aa26.02■■□□□ 1.76
INO80E-211ENST00000567987 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.02■■□□□ 1.76
INO80E-211ENST00000567987 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
INO80E-211ENST00000567987 METP08581 1390 aa26■■□□□ 1.75
INO80E-211ENST00000567987 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.97■■□□□ 1.75
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INO80E-211ENST00000567987 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
INO80E-211ENST00000567987 PRAM1Q96QH2 718 aa25.96■■□□□ 1.75
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INO80E-211ENST00000567987 ABCC11Q96J66 1382 aa25.93■■□□□ 1.74
INO80E-211ENST00000567987 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.92■■□□□ 1.74
INO80E-211ENST00000567987 DLC1Q96QB1 1528 aa25.92■■□□□ 1.74
INO80E-211ENST00000567987 MED14O60244 1454 aa25.91■■□□□ 1.74
INO80E-211ENST00000567987 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
INO80E-211ENST00000567987 PANK3Q9H999 370 aa25.9■■□□□ 1.74
INO80E-211ENST00000567987 MYOM1P52179 1685 aa25.89■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.88■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 CCER2I3L3R5 266 aa25.88■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.88■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.88■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 EVC2Q86UK5 1308 aa25.88■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 TBX22Q9Y458 520 aa25.86■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.86■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.86■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.84■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 TECPR2O15040 1411 aa25.84■■□□□ 1.73
INO80E-211ENST00000567987 DIP2AQ14689 1571 aa25.82■■□□□ 1.72
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