RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 MYOM2P54296 1465 aa24.68■■□□□ 1.54
GDE1-203ENST00000564172 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.68■■□□□ 1.54
GDE1-203ENST00000564172 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.67■■□□□ 1.54
GDE1-203ENST00000564172 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GDE1-203ENST00000564172 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.66■■□□□ 1.54
GDE1-203ENST00000564172 IFT172Q9UG01 1749 aa24.65■■□□□ 1.54
GDE1-203ENST00000564172 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.64■■□□□ 1.53
GDE1-203ENST00000564172 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
GDE1-203ENST00000564172 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.62■■□□□ 1.53
GDE1-203ENST00000564172 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.6■■□□□ 1.53
GDE1-203ENST00000564172 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.6■■□□□ 1.53
GDE1-203ENST00000564172 LAMC1P11047 1609 aa24.6■■□□□ 1.53
GDE1-203ENST00000564172 PPLO60437 1756 aa24.59■■□□□ 1.53
GDE1-203ENST00000564172 MIER1Q8N108 512 aa24.58■■□□□ 1.53
GDE1-203ENST00000564172 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.58■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.57■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.57■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 CCDC7Q96M83 1385 aa24.56■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.55■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 PIK3C2GO75747 1445 aa24.54■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 TNRQ92752 1358 aa24.54■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.54■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.52■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 ZFYVE9O95405 1425 aa24.52■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GDE1-203ENST00000564172 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.51■■□□□ 1.51
GDE1-203ENST00000564172 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.51■■□□□ 1.51
GDE1-203ENST00000564172 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.5■■□□□ 1.51
GDE1-203ENST00000564172 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GDE1-203ENST00000564172 TESK2Q96S53 571 aa24.46■■□□□ 1.51
GDE1-203ENST00000564172 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
GDE1-203ENST00000564172 C3P01024 1663 aa24.46■■□□□ 1.51
GDE1-203ENST00000564172 IQGAP1P46940 1657 aa24.45■■□□□ 1.51
GDE1-203ENST00000564172 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa24.43■■□□□ 1.5
GDE1-203ENST00000564172 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.43■■□□□ 1.5
GDE1-203ENST00000564172 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.42■■□□□ 1.5
GDE1-203ENST00000564172 NLRP1Q9C000 1473 aa24.41■■□□□ 1.5
GDE1-203ENST00000564172 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.41■■□□□ 1.5
GDE1-203ENST00000564172 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.41■■□□□ 1.5
GDE1-203ENST00000564172 ADGRB1O14514 1584 aa24.4■■□□□ 1.5
GDE1-203ENST00000564172 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
GDE1-203ENST00000564172 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 TMF1P82094 1093 aa24.37■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.36■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.35■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.35■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.34■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.34■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 ANP32CO43423 234 aa24.34■■□□□ 1.49
GDE1-203ENST00000564172 ALKQ9UM73 1620 aa24.3■■□□□ 1.48
GDE1-203ENST00000564172 SLC24A1O60721 1099 aa24.29■■□□□ 1.48
GDE1-203ENST00000564172 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.29■■□□□ 1.48
GDE1-203ENST00000564172 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
GDE1-203ENST00000564172 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
GDE1-203ENST00000564172 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.26■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.26■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 LTKP29376 864 aa24.25■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 CDCA8Q53HL2 280 aa24.25■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 STK26Q9P289 416 aa24.24■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 PTPRMP28827 1452 aa24.24■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.23■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 SLIT1O75093 1534 aa24.21■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.21■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.21■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 EID1Q9Y6B2 187 aa24.21■■□□□ 1.47
GDE1-203ENST00000564172 BCANQ96GW7 911 aa24.19■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.18■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 CCER2I3L3R5 266 aa24.18■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 METP08581 1390 aa24.16■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.16■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa24.15■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.14■■□□□ 1.46
GDE1-203ENST00000564172 PRAM1Q96QH2 718 aa24.14■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 PANK3Q9H999 370 aa24.14■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 ABCC11Q96J66 1382 aa24.13■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 POGKQ9P215 609 aa24.12■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 DLC1Q96QB1 1528 aa24.1■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 MED14O60244 1454 aa24.09■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 EVC2Q86UK5 1308 aa24.09■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.08■■□□□ 1.45
GDE1-203ENST00000564172 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
GDE1-203ENST00000564172 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
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