RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563387.5

C15orf40-210, Transcript of chromosome 15 open reading frame 40, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf40, Length 419 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40-210ENST00000563387 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
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C15orf40-210ENST00000563387 ITGAEP38570 1179 aa5.77□□□□□ -1.49
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C15orf40-210ENST00000563387 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 NBPF1Q3BBV0 1214 aa5.67□□□□□ -1.5
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C15orf40-210ENST00000563387 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa5.67□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
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C15orf40-210ENST00000563387 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa5.66□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 TTLL13PA6NNM8 815 aa5.66□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 CD109Q6YHK3 1445 aa5.65□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa5.65□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 KDM5BQ9UGL1 1544 aa5.65□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 CCDC66A2RUB6 948 aa5.65□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 PSEN1P49768 467 aa5.65□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 TMEM106CQ9BVX2 250 aa5.65□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
C15orf40-210ENST00000563387 ERICH3Q5RHP9 1530 aa5.64□□□□□ -1.51
C15orf40-210ENST00000563387 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa5.64□□□□□ -1.51
C15orf40-210ENST00000563387 NBPF9Q3BBW0 867 aa5.64□□□□□ -1.51
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