RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550722.5

HECTD4-211, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HECTD4, Length 15,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-211ENST00000550722 RNF20Q5VTR2 975 aa7.55□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 TPM1P09493 284 aa7.55□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 RABEP1Q15276 862 aa7.55□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 MORC1Q86VD1 984 aa7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 CBX1P83916 185 aa7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 DCAF11Q8TEB1 546 aa7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC34Q96HJ3 373 aa7.53□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.53□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.53□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 HSP90B2PQ58FF3 399 aa7.53□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
HECTD4-211ENST00000550722 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 KRT222Q8N1A0 295 aa7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CEP162Q5TB80 1403 aa7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 VGLL3A8MV65 326 aa7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 KIAA1328Q86T90 577 aa7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CCP110O43303 1012 aa7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.211e-6■■■□□ 17.2
HECTD4-211ENST00000550722 MCM4P33991 863 aa7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CDR1P51861 262 aa7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 TNIKQ9UKE5 1360 aa7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 IVLP07476 585 aa7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 A0A1B0GUL7 405 aa7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 SMC4Q9NTJ3 1288 aa7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 NPHP1O15259 732 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 HDGFP51858 240 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ANAPC15P60006 121 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ITPRIPQ8IWB1 547 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 PDS5BQ9NTI5 1447 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ZNF853P0CG23 659 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ATP6V1AP38606 617 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ST18O60284 1047 aa7.5□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 NUCB2P80303 420 aa7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 SLC4A3P48751 1232 aa7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ZNF592Q92610 1267 aa7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 GPATCH3Q96I76 525 aa7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 TTC36A6NLP5 189 aa7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CUX2O14529 1486 aa7.48□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.48□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CCNB3Q8WWL7 1395 aa7.48□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 APBB1O00213 710 aa7.48□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.48□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 FMNL3Q8IVF7 1028 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC112Q8NEF3 446 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 MIPOL1Q8TD10 442 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 KIF16BQ96L93 1317 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 YY1AP1Q9H869 796 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 KANK1Q14678 1352 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 HMMRO75330 724 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 MNAT1P51948 309 aa7.46□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 FAM184AQ8NB25 1140 aa7.46□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 TRDNQ13061 729 aa7.46□□□□□ -1.21
HECTD4-211ENST00000550722 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 INCENPQ9NQS7 918 aa7.46□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 CCDC191Q8NCU4 936 aa7.46□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 CHMP4CQ96CF2 233 aa7.46□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 CECR2Q9BXF3 1484 aa7.46□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 RGS22Q8NE09 1264 aa7.46□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.46□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HECTD4-211ENST00000550722 MAP2K2P36507 400 aa7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms