RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548896.1

HECTD4-208, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 4

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HECTD4-208	ENST00000548896	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	CUX1	P39880	1505 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	NBPF3	Q9H094	633 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	CERK	Q8TCT0	537 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	HCST	Q9UBK5	93 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HECTD4-208	ENST00000548896	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	SEMA3E	O15041	775 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		14.08	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	TSKS	Q9UJT2	592 aa		14.06	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	PRSS12	P56730	875 aa		14.05	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	WNT2B	Q93097	391 aa		14.04	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	PACS2	Q86VP3	889 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HECTD4-208	ENST00000548896	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	PBRM1	Q86U86	1689 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	NUP160	Q12769	1436 aa		14	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		14	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	GRIN2A	Q12879	1464 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	PTPN5	P54829	565 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
HECTD4-208	ENST00000548896	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		13.96	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	CEP170	Q5SW79	1584 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	ARX	Q96QS3	562 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	SMAP	O00193	183 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	TATDN2	Q93075	761 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	SHROOM2	Q13796	1616 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	PTGDR	Q13258	359 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.92	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	NUTM2F	A1L443	756 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	PADI6	Q6TGC4	694 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	ADAMTS12	P58397	1594 aa		13.91	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	NBPF26	B4DH59	902 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		13.9	□□□□□ -0.18
HECTD4-208	ENST00000548896	BCAM	P50895	628 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	BCAN	Q96GW7	911 aa		13.89	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	TOP2B	Q02880	1626 aa		13.87	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		13.85	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	LRCH3	Q96II8	777 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		13.84	□□□□□ -0.19
HECTD4-208	ENST00000548896	FCHSD2	O94868	740 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	WBP1L	Q9NX94	342 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	EYA1	Q99502	592 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HECTD4-208	ENST00000548896	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	HIC1	Q14526	733 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	PPP4C	P60510	307 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	FAM161A	Q3B820	660 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	GPR37	O15354	613 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HECTD4-208	ENST00000548896	GNPAT	O15228	680 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	IGF1R	P08069	1367 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	FECH	P22830	423 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	DNAJB2	P25686	324 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	RNF40	O75150	1001 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	OAT	P04181	439 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	KIF27	Q86VH2	1401 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HECTD4-208	ENST00000548896	RCCD1	A6NED2	376 aa		13.65	□□□□□ -0.22

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