RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-208ENST00000546997 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.1■■□□□ 1.29
BRF1-208ENST00000546997 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
BRF1-208ENST00000546997 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.09■■□□□ 1.29
BRF1-208ENST00000546997 PPLO60437 1756 aa23.09■■□□□ 1.29
BRF1-208ENST00000546997 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.09■■□□□ 1.29
BRF1-208ENST00000546997 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
BRF1-208ENST00000546997 ADRA2BP18089 450 aa23.07■■□□□ 1.28
BRF1-208ENST00000546997 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.06■■□□□ 1.28
BRF1-208ENST00000546997 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.04■■□□□ 1.28
BRF1-208ENST00000546997 TNRQ92752 1358 aa23.04■■□□□ 1.28
BRF1-208ENST00000546997 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.03■■□□□ 1.28
BRF1-208ENST00000546997 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.02■■□□□ 1.28
BRF1-208ENST00000546997 MYOM2P54296 1465 aa23.02■■□□□ 1.28
BRF1-208ENST00000546997 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
BRF1-208ENST00000546997 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.98■■□□□ 1.27
BRF1-208ENST00000546997 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.97■■□□□ 1.27
BRF1-208ENST00000546997 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.97■■□□□ 1.27
BRF1-208ENST00000546997 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
BRF1-208ENST00000546997 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
BRF1-208ENST00000546997 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 STAC3Q96MF2 364 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.95■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 NLRP1Q9C000 1473 aa22.94■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.93■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 PTPRMP28827 1452 aa22.92■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 PIK3C2GO75747 1445 aa22.91■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 LAMC1P11047 1609 aa22.9■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.9■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.89■■□□□ 1.26
BRF1-208ENST00000546997 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 USP47Q96K76 1375 aa22.88■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 ZFYVE9O95405 1425 aa22.87■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.86■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.85■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 IQGAP1P46940 1657 aa22.84■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
BRF1-208ENST00000546997 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
BRF1-208ENST00000546997 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.82■■□□□ 1.24
BRF1-208ENST00000546997 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.8■■□□□ 1.24
BRF1-208ENST00000546997 ADGRB1O14514 1584 aa22.8■■□□□ 1.24
BRF1-208ENST00000546997 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
BRF1-208ENST00000546997 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.78■■□□□ 1.24
BRF1-208ENST00000546997 SLIT1O75093 1534 aa22.77■■□□□ 1.24
BRF1-208ENST00000546997 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.77■■□□□ 1.24
BRF1-208ENST00000546997 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.76■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 ALKQ9UM73 1620 aa22.75■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.75■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.73■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 BCL11AQ9H165 835 aa22.73■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 LTKP29376 864 aa22.72■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
BRF1-208ENST00000546997 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.69■■□□□ 1.22
BRF1-208ENST00000546997 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
BRF1-208ENST00000546997 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
BRF1-208ENST00000546997 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.68■■□□□ 1.22
BRF1-208ENST00000546997 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.66■■□□□ 1.22
BRF1-208ENST00000546997 TESK2Q96S53 571 aa22.65■■□□□ 1.22
BRF1-208ENST00000546997 EID1Q9Y6B2 187 aa22.65■■□□□ 1.22
BRF1-208ENST00000546997 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
BRF1-208ENST00000546997 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 CCDC7Q96M83 1385 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.64■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.62■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 METP08581 1390 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 BCANQ96GW7 911 aa22.61■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 ANP32CO43423 234 aa22.6■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 STK26Q9P289 416 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 MED14O60244 1454 aa22.59■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 CCER2I3L3R5 266 aa22.58■■□□□ 1.21
BRF1-208ENST00000546997 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.56■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 NEFLP07196 543 aa22.56■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.56■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.55■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 FKBP8Q14318 412 aa22.54■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.54■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 DIP2AQ14689 1571 aa22.54■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.54■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.53■■□□□ 1.2
BRF1-208ENST00000546997 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
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