RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543823.1

SYTL1-208, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYTL1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-208ENST00000543823 IQGAP1P46940 1657 aa25.41■■□□□ 1.66
SYTL1-208ENST00000543823 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SYTL1-208ENST00000543823 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.39■■□□□ 1.65
SYTL1-208ENST00000543823 SYNMO15061 1565 aa25.38■■□□□ 1.65
SYTL1-208ENST00000543823 NOS1P29475 1434 aa25.37■■□□□ 1.65
SYTL1-208ENST00000543823 MYOM2P54296 1465 aa25.37■■□□□ 1.65
SYTL1-208ENST00000543823 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.37■■□□□ 1.65
SYTL1-208ENST00000543823 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.33■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 STAC3Q96MF2 364 aa25.32■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 PIK3C2BO00750 1634 aa25.31■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 PPLO60437 1756 aa25.3■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 NEFLP07196 543 aa25.29■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 TMF1P82094 1093 aa25.29■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.29■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.27■■□□□ 1.64
SYTL1-208ENST00000543823 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 IDI1Q13907 227 aa25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 TMC1Q8TDI8 760 aa25.26■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 PANK3Q9H999 370 aa25.25■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 PIK3C2GO75747 1445 aa25.24■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.22■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 RALBP1Q15311 655 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 REREQ9P2R6 1566 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.21■■□□□ 1.63
SYTL1-208ENST00000543823 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.2■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 MLECQ14165 292 aa25.19■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.18■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 AGLP35573 1532 aa25.18■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 ADGRB1O14514 1584 aa25.18■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.16■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 MYOM1P52179 1685 aa25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
SYTL1-208ENST00000543823 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 ERVK-7P63135 1459 aa25.13■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.13■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.13■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.13■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.12■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.11■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 NLRP13Q86W25 1043 aa25.1■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SYTL1-208ENST00000543823 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SYTL1-208ENST00000543823 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SYTL1-208ENST00000543823 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.04■■□□□ 1.6
SYTL1-208ENST00000543823 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SYTL1-208ENST00000543823 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.02■■□□□ 1.6
SYTL1-208ENST00000543823 CDCA8Q53HL2 280 aa25.01■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.01■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 ZFYVE9O95405 1425 aa24.99■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.98■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 NUDCQ9Y266 331 aa24.97■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.96■■□□□ 1.59
SYTL1-208ENST00000543823 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.95■■□□□ 1.58
SYTL1-208ENST00000543823 ZMYM3Q14202 1370 aa24.94■■□□□ 1.58
SYTL1-208ENST00000543823 STK26Q9P289 416 aa24.93■■□□□ 1.58
SYTL1-208ENST00000543823 PPP2R1AP30153 589 aa24.93■■□□□ 1.58
SYTL1-208ENST00000543823 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
SYTL1-208ENST00000543823 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.92■■□□□ 1.58
SYTL1-208ENST00000543823 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.91■■□□□ 1.58
SYTL1-208ENST00000543823 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.89■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 ALKQ9UM73 1620 aa24.88■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 PTPRMP28827 1452 aa24.86■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.85■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.85■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 SLC24A1O60721 1099 aa24.84■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SYTL1-208ENST00000543823 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.82■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 CABP2Q9NPB3 220 aa24.82■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.81■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.81■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 PRAM1Q96QH2 718 aa24.8■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.8■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SYTL1-208ENST00000543823 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.79■■□□□ 1.56
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