RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 IDI1Q13907 227 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMC1P11047 1609 aa28.13■■■□□ 2.09
PACSIN3-211ENST00000539589 MYOM2P54296 1465 aa28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.09■■■□□ 2.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.09■■■□□ 2.09
PACSIN3-211ENST00000539589 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.09■■■□□ 2.09
PACSIN3-211ENST00000539589 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ZMYM3Q14202 1370 aa28.07■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.04■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.03■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.02■■■□□ 2.08
PACSIN3-211ENST00000539589 IQGAP1P46940 1657 aa28■■■□□ 2.07
PACSIN3-211ENST00000539589 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.98■■■□□ 2.07
PACSIN3-211ENST00000539589 PIK3C2GO75747 1445 aa27.96■■■□□ 2.07
PACSIN3-211ENST00000539589 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.95■■■□□ 2.06
PACSIN3-211ENST00000539589 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
PACSIN3-211ENST00000539589 C3P01024 1663 aa27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-211ENST00000539589 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-211ENST00000539589 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
PACSIN3-211ENST00000539589 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-211ENST00000539589 TESK2Q96S53 571 aa27.89■■■□□ 2.06
PACSIN3-211ENST00000539589 ZFYVE9O95405 1425 aa27.89■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 VGFO15240 615 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 TNRQ92752 1358 aa27.87■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 ADGRB1O14514 1584 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.84■■■□□ 2.05
PACSIN3-211ENST00000539589 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.8■■■□□ 2.04
PACSIN3-211ENST00000539589 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.79■■■□□ 2.04
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.79■■■□□ 2.04
PACSIN3-211ENST00000539589 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
PACSIN3-211ENST00000539589 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.77■■■□□ 2.04
PACSIN3-211ENST00000539589 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa27.75■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.74■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.74■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.73■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 MRS2Q9HD23 443 aa27.72■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 TMF1P82094 1093 aa27.71■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC184Q52MB2 194 aa27.71■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 NLRP1Q9C000 1473 aa27.71■■■□□ 2.03
PACSIN3-211ENST00000539589 ALKQ9UM73 1620 aa27.7■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.7■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.7■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa27.67■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 PTPRMP28827 1452 aa27.65■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.64■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.64■■■□□ 2.02
PACSIN3-211ENST00000539589 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.62■■■□□ 2.01
PACSIN3-211ENST00000539589 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.6■■■□□ 2.01
PACSIN3-211ENST00000539589 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
PACSIN3-211ENST00000539589 MYOM1P52179 1685 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 STK26Q9P289 416 aa27.57■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 LTKP29376 864 aa27.55■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 SLIT1O75093 1534 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.54■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 RALBP1Q15311 655 aa27.52■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 CDCA8Q53HL2 280 aa27.52■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.51■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP27.51■■■□□ 2
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC24A1O60721 1099 aa27.51■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 NEFLP07196 543 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 PANK3Q9H999 370 aa27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 METP08581 1390 aa27.49■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.48■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa27.47■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 FKBP8Q14318 412 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.46■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 TMC1Q8TDI8 760 aa27.45■■□□□ 1.99
PACSIN3-211ENST00000539589 DLC1Q96QB1 1528 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 PRAM1Q96QH2 718 aa27.45■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 ABCC11Q96J66 1382 aa27.42■■□□□ 1.98
PACSIN3-211ENST00000539589 BCANQ96GW7 911 aa27.42■■□□□ 1.98
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