RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532280.1

PTENP1-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 3,996 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-202ENST00000532280 KIF3BO15066 747 aa18.33■□□□□ 0.53
PTENP1-202ENST00000532280 RRP9O43818 475 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
PTENP1-202ENST00000532280 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
PTENP1-202ENST00000532280 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 APAF1O14727 1248 aa18.32■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 COG6Q9Y2V7 657 aa18.32■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 ATP10BO94823 1461 aa18.32■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa18.3■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 PDE3BQ13370 1112 aa18.3■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 MPNDQ8N594 471 aa18.3■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.29■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 TRAK2O60296 914 aa18.28■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 GOLGA2Q08379 1002 aa18.28■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.28■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 ESPNB1AK53 854 aa18.27■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.27■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 SYNJ2O15056 1496 aa18.27■□□□□ 0.52
PTENP1-202ENST00000532280 PPP2R1AP30153 589 aa18.27■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.26■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 GBP4Q96PP9 640 aa18.26■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 CFAP70Q5T0N1 1121 aa18.25■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 RALGAPBQ86X10 1494 aa18.25■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.25■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 GGT6Q6P531 493 aa18.25■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 TRAK1Q9UPV9 953 aa18.25■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.24■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 BCAR3O75815 825 aa18.23■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 TESK2Q96S53 571 aa18.23■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 CDCA8Q53HL2 280 aa18.23■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 ERBINQ96RT1 1412 aa18.22■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 MRE11P49959 708 aa18.21■□□□□ 0.51
PTENP1-202ENST00000532280 APBB1O00213 710 aa18.2■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 CEP170Q5SW79 1584 aa18.19■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.19■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.19■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 MORC1Q86VD1 984 aa18.19■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 PANK1Q8TE04 598 aa18.18■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 TMEM132EQ6IEE7 984 aa18.17■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 PRAG1Q86YV5 1406 aa18.17■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 STK26Q9P289 416 aa18.17■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.16■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 KDM5CP41229 1560 aa18.16■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.16■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 PARD3Q8TEW0 1356 aa18.16■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.15■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 RNF214Q8ND24 703 aa18.15■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 MBD5Q9P267 1494 aa18.15■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.15■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.14■□□□□ 0.5
PTENP1-202ENST00000532280 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.14■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 ADGRL2O95490 1459 aa18.14■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 MCM4P33991 863 aa18.13■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.13■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.11■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.11■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa18.1■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 KIAA2012Q0VF49 1180 aa18.1■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa18.1■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 A2MP01023 1474 aa18.1■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 TPM2P07951 284 aa18.09■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 KANK1Q14678 1352 aa18.09■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PTENP1-202ENST00000532280 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.07■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.07■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.07■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa18.06■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 UQCRHLA0A096LP55 91 aa18.06■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 UQCRHP07919 91 aa18.06■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.05■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 ADGBQ8N7X0 1667 aa18.04■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 CLCN1P35523 988 aa18.04■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 PDCL3Q9H2J4 239 aa18.04■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 NUP160Q12769 1436 aa18.04■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 SLFN5Q08AF3 891 aa18.04■□□□□ 0.48
PTENP1-202ENST00000532280 MCTP1Q6DN14 999 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms