RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529482.5

TSSC2-204, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 2 pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSSC2, Length 2,337 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC2-204ENST00000529482 TMF1P82094 1093 aa20.59■□□□□ 0.89
TSSC2-204ENST00000529482 ZNF521Q96K83 1311 aa20.59■□□□□ 0.89
TSSC2-204ENST00000529482 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
TSSC2-204ENST00000529482 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.58■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.889e-6■■■□□ 15.6
TSSC2-204ENST00000529482 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.57■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 A2MP01023 1474 aa20.57■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 RGL3Q3MIN7 710 aa20.55■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.54■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 SLFN5Q08AF3 891 aa20.53■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 PPP2R1AP30153 589 aa20.53■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.52■□□□□ 0.88
TSSC2-204ENST00000529482 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.5■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 USP19O94966 1318 aa20.5■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 BECN1Q14457 450 aa20.5■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 PLA2R1Q13018 1463 aa20.49■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.871e-8■■■□□ 18.9
TSSC2-204ENST00000529482 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.48■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 POGKQ9P215 609 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 UNC13BO14795 1591 aa20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 PIK3C2GO75747 1445 aa20.46■□□□□ 0.87
TSSC2-204ENST00000529482 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.45■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 DIP2BQ9P265 1576 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 IGHDP01880 384 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 CGNL1Q0VF96 1302 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 PLCH2O75038 1416 aa20.43■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 CD109Q6YHK3 1445 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 SYNMO15061 1565 aa20.42■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 BCAR3O75815 825 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 NINLQ9Y2I6 1382 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 E9PSI1 815 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 PDE3AQ14432 1141 aa20.41■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.4■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.4■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 PREX2Q70Z35 1606 aa20.4■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.4■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 NLRP1Q9C000 1473 aa20.39■□□□□ 0.86
TSSC2-204ENST00000529482 SEC24BO95487 1268 aa20.39■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 GLI2P10070 1586 aa20.39■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 CDCA8Q53HL2 280 aa20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 ATP10AO60312 1499 aa20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.38■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 IQGAP1P46940 1657 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 APAF1O14727 1248 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 NGEFQ8N5V2 710 aa20.37■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.36■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.36■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 PLXNC1O60486 1568 aa20.35■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa20.35■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 FANCAO15360 1455 aa20.34■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 ZMYM3Q14202 1370 aa20.34■□□□□ 0.85
TSSC2-204ENST00000529482 ARAP3Q8WWN8 1544 aa20.32■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 TSPOAP1O95153 1857 aa20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 MADDQ8WXG6 1647 aa20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 MYOM1P52179 1685 aa20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.31■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 AAMPQ13685 434 aa20.3■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.3■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 COG6Q9Y2V7 657 aa20.3■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.29■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.28■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 PANK1Q8TE04 598 aa20.28■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.28■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 FSD2A1L4K1 749 aa20.27■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
TSSC2-204ENST00000529482 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.26■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.25■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.24■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 ADGRL1O94910 1474 aa20.24■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 MCM4P33991 863 aa20.24■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 CLCN1P35523 988 aa20.24■□□□□ 0.83
TSSC2-204ENST00000529482 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms