RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 FAM161AQ3B820 660 aa15.04■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 SLFN5Q08AF3 891 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 C8orf34Q49A92 452 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 CDCA8Q53HL2 280 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 IL27Q8NEV9 243 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.03■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.02■□□□□ -0
PTPRK-217ENST00000524534 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 NFKBIBQ15653 356 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 STAC3Q96MF2 364 aa15.01□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 ABCC2Q92887 1545 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 TRPM2O94759 1503 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.99□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 MYOM1P52179 1685 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 SLC4A3P48751 1232 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 GSE1Q14687 1217 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 PLCH2O75038 1416 aa14.98□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 PTPRTO14522 1441 aa14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 SHROOM2Q13796 1616 aa14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PTPRK-217ENST00000524534 CEP152O94986 1710 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 ABCC1P33527 1531 aa14.95□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 E9PSI1 815 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 APAF1O14727 1248 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 CLTCL1P53675 1640 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 RGS3P49796 1198 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 NGEFQ8N5V2 710 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 BCAR3O75815 825 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 DEPDC5O75140 1603 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 SLC24A1O60721 1099 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRK-217ENST00000524534 PDE3AQ14432 1141 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CHD1O14646 1710 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 IGHDP01880 384 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 ERVK-7P63135 1459 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 TET3O43151 1660 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 USP19O94966 1318 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 BRPF3Q9ULD4 1205 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CARD14Q9BXL6 1004 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 MYOM2P54296 1465 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 WWC1Q8IX03 1113 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 ARAP3Q8WWN8 1544 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 CFAP70Q5T0N1 1121 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 AFAP1Q8N556 730 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.83□□□□□ -0.03
PTPRK-217ENST00000524534 ABCA6Q8N139 1617 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 KANK1Q14678 1352 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 PANK1Q8TE04 598 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 COG6Q9Y2V7 657 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 SEC24BO95487 1268 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 AAMPQ13685 434 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 NLRP1Q9C000 1473 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 NRXN1Q9ULB1 1477 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 SHPRHQ149N8 1683 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 ZMYM3Q14202 1370 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 CANXP27824 592 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 RARSP54136 660 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 ATP7AQ04656 1500 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 IFT172Q9UG01 1749 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRK-217ENST00000524534 BECN1Q14457 450 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-217ENST00000524534 RUNDC1Q96C34 613 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-217ENST00000524534 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.6 ms