RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 NUTM2FA1L443 756 aa8.82□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.82□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.82□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 GFRA3O60609 400 aa8.8□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 BCANQ96GW7 911 aa8.8□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.8□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 SEMA3EO15041 775 aa8.79□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 ZPR1O75312 459 aa8.79□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 GGCXP38435 758 aa8.79□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.79□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 RCCD1A6NED2 376 aa8.78□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 FCHSD2O94868 740 aa8.78□□□□□ -1
HDAC2-216ENST00000523628 FAM161AQ3B820 660 aa8.77□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.77□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.76□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 KMT5BQ4FZB7 885 aa8.75□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.73□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 LCE2BO14633 110 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 OATP04181 439 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 CFHP08603 1231 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 HIC1Q14526 733 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.72□□□□□ -1.01
HDAC2-216ENST00000523628 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 SLC10A3P09131 477 aa8.71□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 RNF223E7ERA6 249 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.7□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 TLL1O43897 1013 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.69□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 NACADO15069 1562 aa8.67□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 GNPATO15228 680 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 NR1I2O75469 434 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 SLC19A1P41440 591 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 ANKLE1Q8NAG6 615 aa8.66□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 S1PR4O95977 384 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 ADH1BP00325 375 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 FECHP22830 423 aa8.65□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HDAC2-216ENST00000523628 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 GPR37O15354 613 aa8.64□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 SPRYD7Q5W111 196 aa8.63□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.63□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.62□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.61□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.61□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.6□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 RDH13Q8NBN7 331 aa8.59□□□□□ -1.03
HDAC2-216ENST00000523628 SPSB2Q99619 263 aa8.58□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 PRR20EP86478 221 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 PRR20CP86479 221 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 PRR20DP86480 221 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 PRR20BP86481 221 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 PRR20AP86496 221 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.57□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 MORN1Q5T089 497 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 NLRP7Q8WX94 980 aa8.56□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 ATP6V1AP38606 617 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 GCGRP47871 477 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 FUT2Q10981 343 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF787Q6DD87 383 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 SULF1Q8IWU6 871 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 PHOX2BQ99453 314 aa8.55□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 GDF9O60383 454 aa8.54□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 DGAT1O75907 488 aa8.54□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 PKDCCQ504Y2 493 aa8.54□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 THAP11Q96EK4 314 aa8.53□□□□□ -1.04
HDAC2-216ENST00000523628 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 TNFRSF10AO00220 468 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 MYT1Q01538 1121 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 RPIAP49247 311 aa8.49□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 FAM187AA6NFU0 413 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 GRIPAP1Q4V328 841 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.48□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 MAP2K5Q13163 448 aa8.47□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 BRICD5Q6PL45 260 aa8.47□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.47□□□□□ -1.05
HDAC2-216ENST00000523628 CD46P15529 392 aa8.46□□□□□ -1.06
HDAC2-216ENST00000523628 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
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