RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 AFAP1Q8N556 730 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 USP35Q9P2H5 1018 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 SLFN5Q08AF3 891 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 CHD1O14646 1710 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 IQGAP1P46940 1657 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM200B-202ENST00000521452 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.13■■■□□ 2.09
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TMEM200B-202ENST00000521452 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 SYNMO15061 1565 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 APAF1O14727 1248 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 SHROOM2Q13796 1616 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 PIK3C2GO75747 1445 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC1P33527 1531 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.08■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 TRPM2O94759 1503 aa28.08■■■□□ 2.09
TMEM200B-202ENST00000521452 C8orf34Q49A92 452 aa28.07■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 RGS3P49796 1198 aa28.07■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 PTPRTO14522 1441 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM161AQ3B820 660 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 BCAR3O75815 825 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 STAC3Q96MF2 364 aa28.05■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.04■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CLTCL1P53675 1640 aa28.04■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.03■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.03■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.02■■■□□ 2.08
TMEM200B-202ENST00000521452 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 IL27Q8NEV9 243 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 MYOM1P52179 1685 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 CARD14Q9BXL6 1004 aa28■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP152O94986 1710 aa28■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.97■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF3BO15066 747 aa27.97■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 NFKBIBQ15653 356 aa27.97■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.97■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 E9PSI1 815 aa27.96■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa27.96■■■□□ 2.07
TMEM200B-202ENST00000521452 ERVK-7P63135 1459 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM200B-202ENST00000521452 KANK1Q14678 1352 aa27.93■■■□□ 2.06
TMEM200B-202ENST00000521452 IGHDP01880 384 aa27.92■■■□□ 2.06
TMEM200B-202ENST00000521452 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
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TMEM200B-202ENST00000521452 TET3O43151 1660 aa27.89■■■□□ 2.05
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TMEM200B-202ENST00000521452 SLC24A1O60721 1099 aa27.85■■■□□ 2.05
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TMEM200B-202ENST00000521452 NEUROD2Q15784 382 aa27.85■■■□□ 2.05
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TMEM200B-202ENST00000521452 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.83■■■□□ 2.05
TMEM200B-202ENST00000521452 ATP7AQ04656 1500 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 PDE3AQ14432 1141 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCA6Q8N139 1617 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.82■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.81■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 VWDEQ8N2E2 1590 aa27.81■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 NGEFQ8N5V2 710 aa27.81■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.8■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 FANCAO15360 1455 aa27.79■■■□□ 2.04
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TMEM200B-202ENST00000521452 MORC1Q86VD1 984 aa27.78■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.77■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.77■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.77■■■□□ 2.04
TMEM200B-202ENST00000521452 SEC24BO95487 1268 aa27.75■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 USP19O94966 1318 aa27.75■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 NSD3Q9BZ95 1437 aa27.74■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.74■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.73■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.72■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.71■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 NOS1P29475 1434 aa27.71■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 RARSP54136 660 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 ADGRL1O94910 1474 aa27.71■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 RUNDC1Q96C34 613 aa27.71■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.71■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 BCL2L13Q9BXK5 485 aa27.7■■■□□ 2.03
TMEM200B-202ENST00000521452 TNNQ9UQP3 1299 aa27.7■■■□□ 2.03
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