RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 PTPRMP28827 1452 aa22.04■■□□□ 1.12
TRPS1-206ENST00000517323 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.04■■□□□ 1.12
TRPS1-206ENST00000517323 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.04■■□□□ 1.12
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TRPS1-206ENST00000517323 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.03■■□□□ 1.12
TRPS1-206ENST00000517323 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
TRPS1-206ENST00000517323 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.02■■□□□ 1.12
TRPS1-206ENST00000517323 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TRPS1-206ENST00000517323 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.01■■□□□ 1.11
TRPS1-206ENST00000517323 MYOM2P54296 1465 aa22■■□□□ 1.11
TRPS1-206ENST00000517323 RIMS2Q9UQ26 1411 aa21.97■■□□□ 1.11
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.97■■□□□ 1.11
TRPS1-206ENST00000517323 NLRP1Q9C000 1473 aa21.96■■□□□ 1.11
TRPS1-206ENST00000517323 NRXN1Q9ULB1 1477 aa21.96■■□□□ 1.11
TRPS1-206ENST00000517323 PIK3C2GO75747 1445 aa21.96■■□□□ 1.11
TRPS1-206ENST00000517323 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21.95■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 USP47Q96K76 1375 aa21.94■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 ZFYVE9O95405 1425 aa21.94■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 LTKP29376 864 aa21.94■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.92■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.89■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
TRPS1-206ENST00000517323 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 IQGAP1P46940 1657 aa21.88■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 BCANQ96GW7 911 aa21.88■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.87■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.87■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.87■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.86■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.86■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 STAC3Q96MF2 364 aa21.85■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 ADGRB1O14514 1584 aa21.85■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 STK26Q9P289 416 aa21.85■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.85■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 ALKQ9UM73 1620 aa21.84■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TRPS1-206ENST00000517323 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.82■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 HSPA2P54652 639 aa21.81■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 LAMC1P11047 1609 aa21.81■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 SLIT1O75093 1534 aa21.81■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.81■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.8■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.8■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 METP08581 1390 aa21.79■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 EID1Q9Y6B2 187 aa21.78■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.77■■□□□ 1.08
TRPS1-206ENST00000517323 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.75■■□□□ 1.07
TRPS1-206ENST00000517323 TESK2Q96S53 571 aa21.75■■□□□ 1.07
TRPS1-206ENST00000517323 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.75■■□□□ 1.07
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TRPS1-206ENST00000517323 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.73■■□□□ 1.07
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.73■■□□□ 1.07
TRPS1-206ENST00000517323 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TRPS1-206ENST00000517323 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
TRPS1-206ENST00000517323 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.73■■□□□ 1.07
TRPS1-206ENST00000517323 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
TRPS1-206ENST00000517323 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.7■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC7Q96M83 1385 aa21.69■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.69■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.69■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.68■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.67■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 PRAM1Q96QH2 718 aa21.67■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 PTPRUQ92729 1446 aa21.66■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 MED14O60244 1454 aa21.65■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
TRPS1-206ENST00000517323 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 POGKQ9P215 609 aa21.61■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.6■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 TMF1P82094 1093 aa21.59■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa21.59■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 TBX22Q9Y458 520 aa21.58■■□□□ 1.05
TRPS1-206ENST00000517323 STRCQ7RTU9 1775 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 ABCC11Q96J66 1382 aa21.56■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 KCNA6P17658 529 aa21.56■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 MIER1Q8N108 512 aa21.54■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 CABP2Q9NPB3 220 aa21.54■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 KNDC1Q76NI1 1749 aa21.54■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 DIP2AQ14689 1571 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 CPS1P31327 1500 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRPS1-206ENST00000517323 DLC1Q96QB1 1528 aa21.52■■□□□ 1.03
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