RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GDF9O60383 454 aa3.93□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 S1PR4O95977 384 aa3.93□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLF2Q8IX21 1173 aa3.93□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa3.93□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC10A3P09131 477 aa3.92□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR20EP86478 221 aa3.92□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR20CP86479 221 aa3.92□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR20DP86480 221 aa3.92□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR20BP86481 221 aa3.92□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR20AP86496 221 aa3.92□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCE2CQ5TA81 110 aa3.92□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DACH1Q9UI36 760 aa3.92□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GGCXP38435 758 aa3.91□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PTGDRQ13258 359 aa3.91□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKLE1Q8NAG6 615 aa3.91□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKD2L1Q9P0L9 805 aa3.91□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADGRG1Q9Y653 693 aa3.91□□□□□ -1.78
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM187AA6NFU0 413 aa3.9□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DGAT1O75907 488 aa3.9□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PKDCCQ504Y2 493 aa3.9□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF697Q5TEC3 545 aa3.9□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM134Q9H6X4 195 aa3.9□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AAASQ9NRG9 546 aa3.9□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFHP08603 1231 aa3.89□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HDGFP51858 240 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa3.89□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RCCD1A6NED2 376 aa3.88□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DNAJB2P25686 324 aa3.88□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TREML4Q6UXN2 200 aa3.88□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ADH1BP00325 375 aa3.87□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NECTIN2Q92692 538 aa3.87□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KCNV2Q8TDN2 545 aa3.86□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRR14Q9BWN1 585 aa3.86□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SCUBE3Q8IX30 993 aa3.85□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRIPAKQ8N1N5 446 aa3.85□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 THAP11Q96EK4 314 aa3.85□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CFAP44Q96MT7 982 aa3.85□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC6A16Q9GZN6 736 aa3.85□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TOR4AQ9NXH8 423 aa3.85□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AVPP01185 164 aa3.84□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FOXC1Q12948 553 aa3.84□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PXYLP1Q8TE99 480 aa3.84□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NLRP7Q8WX94 980 aa3.84□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRDM9Q9NQV7 894 aa3.84□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR70Q9NW82 654 aa3.84□□□□□ -1.79
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FECHP22830 423 aa3.83□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KMT5BQ4FZB7 885 aa3.83□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR37O15354 613 aa3.82□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NR1I2O75469 434 aa3.82□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MORN1Q5T089 497 aa3.82□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPSB2Q99619 263 aa3.82□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa3.82□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NUTM2FA1L443 756 aa3.81□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC4A3P48751 1232 aa3.81□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHOX2BQ99453 314 aa3.81□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SEMA3EO15041 775 aa3.8□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WFS1O76024 890 aa3.8□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMPD1P17405 629 aa3.8□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FUT2Q10981 343 aa3.8□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa3.8□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa3.8□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 AXIN1O15169 862 aa3.79□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WIPF1O43516 503 aa3.79□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPIAP49247 311 aa3.79□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LMOD2Q6P5Q4 547 aa3.79□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 J3QL48 77 aa3.78□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FCHSD2O94868 740 aa3.78□□□□□ -1.8
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BRICD5Q6PL45 260 aa3.77□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP4X1Q8N118 509 aa3.77□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa3.77□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WNT7AO00755 349 aa3.76□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OATP04181 439 aa3.76□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SKOR1P84550 965 aa3.76□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CTC1Q2NKJ3 1217 aa3.76□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPS1Q92902 700 aa3.76□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DDX11L8A8MPP1 907 aa3.75□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TERTO14746 1132 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ATP6V1AP38606 617 aa3.75□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GCGRP47871 477 aa3.75□□□□□ -1.81
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRIM32Q13049 653 aa3.75□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms