RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	NOS1	P29475	1434 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PDE4D-223	ENST00000515011	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PDE4D-223	ENST00000515011	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PDE4D-223	ENST00000515011	RALBP1	Q15311	655 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PDE4D-223	ENST00000515011	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		31.2	■■■□□ 2.59
PDE4D-223	ENST00000515011	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PPL	O60437	1756 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	SYNM	O15061	1565 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	TSPOAP1	O95153	1857 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PDE4D-223	ENST00000515011	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	RERE	Q9P2R6	1566 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PIK3C2G	O75747	1445 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	PANK3	Q9H999	370 aa		31.07	■■■□□ 2.57
PDE4D-223	ENST00000515011	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.07	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	NEFL	P07196	543 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	AGL	P35573	1532 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	FKBP8	Q14318	412 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	MYOM1	P52179	1685 aa		31.03	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.03	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	31.02	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PDE4D-223	ENST00000515011	NLRP13	Q86W25	1043 aa		31	■■■□□ 2.55
PDE4D-223	ENST00000515011	ADGRB1	O14514	1584 aa		31	■■■□□ 2.55
PDE4D-223	ENST00000515011	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	30.99	■■■□□ 2.55
PDE4D-223	ENST00000515011	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PDE4D-223	ENST00000515011	ERVK-7	P63135	1459 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		30.96	■■■□□ 2.55
PDE4D-223	ENST00000515011	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	30.94	■■■□□ 2.54
PDE4D-223	ENST00000515011	IDI1	Q13907	227 aa		30.93	■■■□□ 2.54
PDE4D-223	ENST00000515011	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	30.92	■■■□□ 2.54
PDE4D-223	ENST00000515011	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		30.92	■■■□□ 2.54
PDE4D-223	ENST00000515011	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		30.92	■■■□□ 2.54
PDE4D-223	ENST00000515011	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PDE4D-223	ENST00000515011	ZFYVE9	O95405	1425 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PDE4D-223	ENST00000515011	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	30.9	■■■□□ 2.54
PDE4D-223	ENST00000515011	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	30.88	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		30.87	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		30.87	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		30.87	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		30.86	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	30.84	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		30.84	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	30.84	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	30.84	■■■□□ 2.53
PDE4D-223	ENST00000515011	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	30.82	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	BCAN	Q96GW7	911 aa		30.82	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	INSR	P06213	1382 aa		30.82	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		30.81	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		30.79	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	30.79	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	30.79	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		30.78	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	30.76	■■■□□ 2.52
PDE4D-223	ENST00000515011	NUDC	Q9Y266	331 aa		30.73	■■■□□ 2.51
PDE4D-223	ENST00000515011	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	30.72	■■■□□ 2.51
PDE4D-223	ENST00000515011	PPP2R1A	P30153	589 aa		30.71	■■■□□ 2.51
PDE4D-223	ENST00000515011	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		30.69	■■■□□ 2.5
PDE4D-223	ENST00000515011	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		30.66	■■■□□ 2.5
PDE4D-223	ENST00000515011	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		30.66	■■■□□ 2.5
PDE4D-223	ENST00000515011	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	30.65	■■■□□ 2.5
PDE4D-223	ENST00000515011	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		30.64	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	MLEC	Q14165	292 aa		30.63	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	30.62	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	ALK	Q9UM73	1620 aa		30.61	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	EVC2	Q86UK5	1308 aa		30.6	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		30.59	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		30.59	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	USP32	Q8NFA0	1604 aa		30.59	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	PTPRM	P28827	1452 aa		30.59	■■■□□ 2.49
PDE4D-223	ENST00000515011	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	30.57	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		30.57	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	PDE3B	Q13370	1112 aa		30.56	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		30.56	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	ZMYM3	Q14202	1370 aa		30.55	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		30.54	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		30.54	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	30.52	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		30.51	■■■□□ 2.48
PDE4D-223	ENST00000515011	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	30.51	■■■□□ 2.47
PDE4D-223	ENST00000515011	STK26	Q9P289	416 aa		30.51	■■■□□ 2.47
PDE4D-223	ENST00000515011	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	30.5	■■■□□ 2.47
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		30.48	■■■□□ 2.47
PDE4D-223	ENST00000515011	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		30.48	■■■□□ 2.47

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