RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514596.1

CTBP1-215, Transcript of C-terminal binding protein 1, human

TSL 2

Gene CTBP1, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP1-215	ENST00000514596	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	28.22	■■■□□ 2.11
CTBP1-215	ENST00000514596	NAIP	Q13075	1403 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CTBP1-215	ENST00000514596	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.21	■■■□□ 2.11
CTBP1-215	ENST00000514596	TET3	O43151	1660 aa		28.19	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	MSH6	P52701	1360 aa		28.19	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28.18	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	NWD1	Q149M9	1564 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	28.17	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	PHLPP1	O60346	1717 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	IDI1	Q13907	227 aa		28.16	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	JCAD	Q9P266	1359 aa		28.15	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
CTBP1-215	ENST00000514596	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.13	■■■□□ 2.09
CTBP1-215	ENST00000514596	SLAIN2	Q9P270	581 aa		28.12	■■■□□ 2.09
CTBP1-215	ENST00000514596	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.11	■■■□□ 2.09
CTBP1-215	ENST00000514596	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
CTBP1-215	ENST00000514596	NOS1	P29475	1434 aa		28.07	■■■□□ 2.08
CTBP1-215	ENST00000514596	NUP155	O75694	1391 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.05	■■■□□ 2.08
CTBP1-215	ENST00000514596	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	28.03	■■■□□ 2.08
CTBP1-215	ENST00000514596	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		28.01	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596		E9PCH4	1651 aa		28	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		27.99	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		27.98	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		27.97	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	ZFYVE9	O95405	1425 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	LRP6	O75581	1613 aa		27.96	■■■□□ 2.07
CTBP1-215	ENST00000514596	C14orf37	Q86TY3	774 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	27.94	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	SHPRH	Q149N8	1683 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	TRIM52	Q96A61	297 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		27.92	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	TBX22	Q9Y458	520 aa		27.9	■■■□□ 2.06
CTBP1-215	ENST00000514596	ATF3	P18847	181 aa		27.88	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	DIP2A	Q14689	1571 aa		27.86	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	RXRB	P28702	533 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	PIK3R4	Q99570	1358 aa		27.83	■■■□□ 2.05
CTBP1-215	ENST00000514596	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.04
CTBP1-215	ENST00000514596	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
CTBP1-215	ENST00000514596	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		27.79	■■■□□ 2.04
CTBP1-215	ENST00000514596	TRPM2	O94759	1503 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CTBP1-215	ENST00000514596	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
CTBP1-215	ENST00000514596	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CTBP1-215	ENST00000514596	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CTBP1-215	ENST00000514596	HRC	P23327	699 aa		27.76	■■■□□ 2.03
CTBP1-215	ENST00000514596	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
CTBP1-215	ENST00000514596	BRINP3	Q76B58	766 aa		27.75	■■■□□ 2.03
CTBP1-215	ENST00000514596	DCC	P43146	1447 aa		27.74	■■■□□ 2.03
CTBP1-215	ENST00000514596	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
CTBP1-215	ENST00000514596	AFF2	P51816	1311 aa		27.71	■■■□□ 2.03
CTBP1-215	ENST00000514596	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CTBP1-215	ENST00000514596	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		27.7	■■■□□ 2.02
CTBP1-215	ENST00000514596	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
CTBP1-215	ENST00000514596	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CTBP1-215	ENST00000514596	CLTCL1	P53675	1640 aa		27.69	■■■□□ 2.02
CTBP1-215	ENST00000514596	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		27.65	■■■□□ 2.02
CTBP1-215	ENST00000514596	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
CTBP1-215	ENST00000514596	PTPRU	Q92729	1446 aa		27.64	■■■□□ 2.02
CTBP1-215	ENST00000514596	KIF1B	O60333	1816 aa		27.64	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	RGS12	O14924	1447 aa		27.62	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	27.61	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	MST1R	Q04912	1400 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	C8orf37	Q96NL8	207 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	FOXD1	Q16676	465 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CTBP1-215	ENST00000514596	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		27.58	■■■□□ 2
CTBP1-215	ENST00000514596	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		27.56	■■■□□ 2
CTBP1-215	ENST00000514596	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		27.55	■■■□□ 2
CTBP1-215	ENST00000514596	NGLY1	Q96IV0	654 aa		27.54	■■■□□ 2
CTBP1-215	ENST00000514596	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		27.54	■■■□□ 2
CTBP1-215	ENST00000514596	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		27.52	■■■□□ 2
CTBP1-215	ENST00000514596	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		27.5	■■□□□ 1.99
CTBP1-215	ENST00000514596	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CTBP1-215	ENST00000514596	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
CTBP1-215	ENST00000514596	MET	P08581	1390 aa		27.47	■■□□□ 1.99
CTBP1-215	ENST00000514596	ADAMTS2	O95450	1211 aa		27.46	■■□□□ 1.99
CTBP1-215	ENST00000514596	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	27.46	■■□□□ 1.99
CTBP1-215	ENST00000514596	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		27.46	■■□□□ 1.99
CTBP1-215	ENST00000514596	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		27.46	■■□□□ 1.99
CTBP1-215	ENST00000514596	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		27.42	■■□□□ 1.98
CTBP1-215	ENST00000514596	PPL	O60437	1756 aa		27.42	■■□□□ 1.98
CTBP1-215	ENST00000514596	LAMC1	P11047	1609 aa		27.41	■■□□□ 1.98

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