RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514153.5

FAM149A-215, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, human

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene FAM149A, Length 2,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM149A-215	ENST00000514153	C3	P01024	1663 aa		43.06	■■■■■ 4.48
FAM149A-215	ENST00000514153	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	43.06	■■■■■ 4.48
FAM149A-215	ENST00000514153	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		43.05	■■■■■ 4.48
FAM149A-215	ENST00000514153	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		43.03	■■■■■ 4.48
FAM149A-215	ENST00000514153	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		43.03	■■■■■ 4.48
FAM149A-215	ENST00000514153	TNR	Q92752	1358 aa		43.03	■■■■■ 4.48
FAM149A-215	ENST00000514153	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		42.99	■■■■■ 4.47
FAM149A-215	ENST00000514153	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		42.99	■■■■■ 4.47
FAM149A-215	ENST00000514153	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	42.95	■■■■■ 4.47
FAM149A-215	ENST00000514153	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		42.94	■■■■■ 4.46
FAM149A-215	ENST00000514153	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		42.93	■■■■■ 4.46
FAM149A-215	ENST00000514153	LAMC1	P11047	1609 aa		42.93	■■■■■ 4.46
FAM149A-215	ENST00000514153	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM149A-215	ENST00000514153	PIK3C2G	O75747	1445 aa		42.9	■■■■■ 4.46
FAM149A-215	ENST00000514153	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FAM149A-215	ENST00000514153	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	42.89	■■■■■ 4.46
FAM149A-215	ENST00000514153	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.46
FAM149A-215	ENST00000514153	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		42.88	■■■■■ 4.45
FAM149A-215	ENST00000514153	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	42.88	■■■■■ 4.45
FAM149A-215	ENST00000514153	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
FAM149A-215	ENST00000514153	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		42.85	■■■■■ 4.45
FAM149A-215	ENST00000514153	ZFYVE9	O95405	1425 aa		42.78	■■■■■ 4.44
FAM149A-215	ENST00000514153	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		42.78	■■■■■ 4.44
FAM149A-215	ENST00000514153	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.77	■■■■■ 4.44
FAM149A-215	ENST00000514153	NLRP1	Q9C000	1473 aa		42.77	■■■■■ 4.44
FAM149A-215	ENST00000514153	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		42.77	■■■■■ 4.44
FAM149A-215	ENST00000514153	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
FAM149A-215	ENST00000514153	CCDC7	Q96M83	1385 aa		42.73	■■■■■ 4.43
FAM149A-215	ENST00000514153	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.73	■■■■■ 4.43
FAM149A-215	ENST00000514153	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
FAM149A-215	ENST00000514153	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		42.71	■■■■■ 4.43
FAM149A-215	ENST00000514153	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	42.71	■■■■■ 4.43
FAM149A-215	ENST00000514153	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		42.69	■■■■■ 4.42
FAM149A-215	ENST00000514153	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		42.69	■■■■■ 4.42
FAM149A-215	ENST00000514153	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		42.67	■■■■■ 4.42
FAM149A-215	ENST00000514153	ADGRB1	O14514	1584 aa		42.66	■■■■■ 4.42
FAM149A-215	ENST00000514153	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		42.64	■■■■■ 4.42
FAM149A-215	ENST00000514153	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FAM149A-215	ENST00000514153	MIER1	Q8N108	512 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FAM149A-215	ENST00000514153	TESK2	Q96S53	571 aa		42.61	■■■■■ 4.41
FAM149A-215	ENST00000514153	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	42.58	■■■■■ 4.41
FAM149A-215	ENST00000514153	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
FAM149A-215	ENST00000514153	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		42.56	■■■■■ 4.4
FAM149A-215	ENST00000514153	ALK	Q9UM73	1620 aa		42.55	■■■■■ 4.4
FAM149A-215	ENST00000514153	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		42.54	■■■■■ 4.4
FAM149A-215	ENST00000514153	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
FAM149A-215	ENST00000514153	PTPRM	P28827	1452 aa		42.52	■■■■■ 4.4
FAM149A-215	ENST00000514153	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	42.51	■■■■■ 4.4
FAM149A-215	ENST00000514153	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		42.5	■■■■■ 4.39
FAM149A-215	ENST00000514153	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		42.48	■■■■■ 4.39
FAM149A-215	ENST00000514153	LTK	P29376	864 aa		42.48	■■■■■ 4.39
FAM149A-215	ENST00000514153	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	42.46	■■■■■ 4.39
FAM149A-215	ENST00000514153	STK26	Q9P289	416 aa		42.45	■■■■■ 4.39
FAM149A-215	ENST00000514153	BCAN	Q96GW7	911 aa		42.45	■■■■■ 4.39
FAM149A-215	ENST00000514153	TMF1	P82094	1093 aa		42.44	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.44	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	SLIT1	O75093	1534 aa		42.43	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.41	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.4	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	42.39	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	42.39	■■■■■ 4.38
FAM149A-215	ENST00000514153	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
FAM149A-215	ENST00000514153	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
FAM149A-215	ENST00000514153	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		42.34	■■■■■ 4.37
FAM149A-215	ENST00000514153	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		42.33	■■■■■ 4.37
FAM149A-215	ENST00000514153	MET	P08581	1390 aa		42.31	■■■■■ 4.36
FAM149A-215	ENST00000514153	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	42.28	■■■■■ 4.36
FAM149A-215	ENST00000514153	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		42.28	■■■■■ 4.36
FAM149A-215	ENST00000514153	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		42.25	■■■■■ 4.35
FAM149A-215	ENST00000514153	ANP32C	O43423	234 aa		42.24	■■■■■ 4.35
FAM149A-215	ENST00000514153	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		42.23	■■■■■ 4.35
FAM149A-215	ENST00000514153	PRAM1	Q96QH2	718 aa		42.22	■■■■■ 4.35
FAM149A-215	ENST00000514153	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	42.21	■■■■■ 4.35
FAM149A-215	ENST00000514153	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		42.2	■■■■■ 4.35
FAM149A-215	ENST00000514153	CDCA8	Q53HL2	280 aa		42.19	■■■■■ 4.34
FAM149A-215	ENST00000514153	POGK	Q9P215	609 aa		42.18	■■■■■ 4.34
FAM149A-215	ENST00000514153	SLC24A1	O60721	1099 aa		42.17	■■■■■ 4.34
FAM149A-215	ENST00000514153	MED14	O60244	1454 aa		42.14	■■■■■ 4.34
FAM149A-215	ENST00000514153	ABCC11	Q96J66	1382 aa		42.13	■■■■■ 4.34
FAM149A-215	ENST00000514153	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		42.13	■■■■■ 4.33
FAM149A-215	ENST00000514153	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.12	■■■■■ 4.33
FAM149A-215	ENST00000514153	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		42.11	■■■■■ 4.33
FAM149A-215	ENST00000514153	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	42.09	■■■■■ 4.33
FAM149A-215	ENST00000514153	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		42.09	■■■■■ 4.33
FAM149A-215	ENST00000514153	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
FAM149A-215	ENST00000514153	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		42.08	■■■■■ 4.33
FAM149A-215	ENST00000514153	MYOM1	P52179	1685 aa		42.07	■■■■■ 4.33
FAM149A-215	ENST00000514153	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		42.06	■■■■■ 4.32
FAM149A-215	ENST00000514153	PANK3	Q9H999	370 aa		42.05	■■■■■ 4.32
FAM149A-215	ENST00000514153	TBX22	Q9Y458	520 aa		42.05	■■■■■ 4.32
FAM149A-215	ENST00000514153	EVC2	Q86UK5	1308 aa		42.03	■■■■■ 4.32
FAM149A-215	ENST00000514153	PTPRU	Q92729	1446 aa		42.03	■■■■■ 4.32
FAM149A-215	ENST00000514153	DIP2A	Q14689	1571 aa		42.02	■■■■■ 4.32
FAM149A-215	ENST00000514153	TECPR2	O15040	1411 aa		42.01	■■■■■ 4.32
FAM149A-215	ENST00000514153	CPS1	P31327	1500 aa		42	■■■■■ 4.31
FAM149A-215	ENST00000514153	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	41.97	■■■■■ 4.31
FAM149A-215	ENST00000514153	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		41.97	■■■■■ 4.31
FAM149A-215	ENST00000514153	CABP2	Q9NPB3	220 aa		41.97	■■■■■ 4.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms