RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 NGLY1Q96IV0 654 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 C8orf37Q96NL8 207 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.19■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.17■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC125Q86Z20 511 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2B-207ENST00000510021 CADPS2Q86UW7 1296 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.13■■□□□ 1.61
UBE2B-207ENST00000510021 BRINP3Q76B58 766 aa25.12■■□□□ 1.61
UBE2B-207ENST00000510021 C14orf37Q86TY3 774 aa25.08■■□□□ 1.61
UBE2B-207ENST00000510021 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 CEP162Q5TB80 1403 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 ATF3P18847 181 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.07■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 TSPY4P0CV99 314 aa25.06■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 TSPY10P0CW01 314 aa25.06■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.06■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.06■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 IDI1Q13907 227 aa25.05■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 BCANQ96GW7 911 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.04■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 ADGRB3O60242 1522 aa25.03■■□□□ 1.6
UBE2B-207ENST00000510021 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
UBE2B-207ENST00000510021 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
UBE2B-207ENST00000510021 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.99■■□□□ 1.59
UBE2B-207ENST00000510021 ATRNO75882 1429 aa24.97■■□□□ 1.59
UBE2B-207ENST00000510021 ADAMTS2O95450 1211 aa24.97■■□□□ 1.59
UBE2B-207ENST00000510021 USP21Q9UK80 565 aa24.97■■□□□ 1.59
UBE2B-207ENST00000510021 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
UBE2B-207ENST00000510021 ZFYVE9O95405 1425 aa24.95■■□□□ 1.58
UBE2B-207ENST00000510021 DCCP43146 1447 aa24.93■■□□□ 1.58
UBE2B-207ENST00000510021 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.92■■□□□ 1.58
UBE2B-207ENST00000510021 TBX22Q9Y458 520 aa24.92■■□□□ 1.58
UBE2B-207ENST00000510021 IFFO2Q5TF58 517 aa24.91■■□□□ 1.58
UBE2B-207ENST00000510021 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.91■■□□□ 1.58
UBE2B-207ENST00000510021 MST1RQ04912 1400 aa24.9■■□□□ 1.58
UBE2B-207ENST00000510021 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
UBE2B-207ENST00000510021 YY1P25490 414 aa24.88■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.88■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 NOS1P29475 1434 aa24.87■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 HRCP23327 699 aa24.87■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.85■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 PIK3R4Q99570 1358 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 PTCH1Q13635 1447 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.84■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.83■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
UBE2B-207ENST00000510021 ERBINQ96RT1 1412 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2B-207ENST00000510021 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
UBE2B-207ENST00000510021 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2B-207ENST00000510021 UNC13BO14795 1591 aa24.8■■□□□ 1.56
UBE2B-207ENST00000510021 KANK1Q14678 1352 aa24.78■■□□□ 1.56
UBE2B-207ENST00000510021 TRPM2O94759 1503 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 PTPRUQ92729 1446 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 LAMC1P11047 1609 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 KIF15Q9NS87 1388 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.72■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
UBE2B-207ENST00000510021 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 GLI3P10071 1580 aa24.7■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 MYOM2P54296 1465 aa24.66■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.65■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.64■■□□□ 1.54
UBE2B-207ENST00000510021 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-207ENST00000510021 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-207ENST00000510021 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-207ENST00000510021 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-207ENST00000510021 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
UBE2B-207ENST00000510021 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2B-207ENST00000510021 BAG6P46379 1132 aa24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-207ENST00000510021 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-207ENST00000510021 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2B-207ENST00000510021 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.54■■□□□ 1.52
UBE2B-207ENST00000510021 SLIT2O94813 1529 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2B-207ENST00000510021 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2B-207ENST00000510021 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2B-207ENST00000510021 ORAI2Q96SN7 254 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC5O15440 1437 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-207ENST00000510021 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
UBE2B-207ENST00000510021 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.48■■□□□ 1.51
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