RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 DDRGK1Q96HY6 314 aa3.97□□□□□ -1.77
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PDE4D-218ENST00000509368 TRIM66O15016 1216 aa3.97□□□□□ -1.77
PDE4D-218ENST00000509368 PDE4DQ08499 809 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4D-218ENST00000509368 PADI6Q6TGC4 694 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4D-218ENST00000509368 TSKSQ9UJT2 592 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4D-218ENST00000509368 GNPATO15228 680 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4D-218ENST00000509368 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa3.96□□□□□ -1.78
PDE4D-218ENST00000509368 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
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PDE4D-218ENST00000509368 BCL2L12Q9HB09 334 aa3.94□□□□□ -1.78
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PDE4D-218ENST00000509368 IL27Q8NEV9 243 aa3.93□□□□□ -1.78
PDE4D-218ENST00000509368 EPAS1Q99814 870 aa3.93□□□□□ -1.78
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PDE4D-218ENST00000509368 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
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PDE4D-218ENST00000509368 MS4A1P11836 297 aa3.92□□□□□ -1.78
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PDE4D-218ENST00000509368 FBXW7Q969H0 707 aa3.92□□□□□ -1.78
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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PDE4D-218ENST00000509368 ADGRG1Q9Y653 693 aa3.91□□□□□ -1.78
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PDE4D-218ENST00000509368 TMEM134Q9H6X4 195 aa3.84□□□□□ -1.8
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PDE4D-218ENST00000509368 GUCA2AQ02747 115 aa3.83□□□□□ -1.8
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