RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRP6O75581 1613 aa16.59■□□□□ 0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 MYO5BQ9ULV0 1848 aa16.59■□□□□ 0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRIM52Q96A61 297 aa16.58■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIF15Q9NS87 1388 aa16.58■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADGRB3O60242 1522 aa16.57■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERBINQ96RT1 1412 aa16.57■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLAIN2Q9P270 581 aa16.57■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 BCANQ96GW7 911 aa16.56■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 KANK1Q14678 1352 aa16.55■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 IDI1Q13907 227 aa16.55■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SHPRHQ149N8 1683 aa16.55■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 GCC2Q8IWJ2 1684 aa16.52■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.51■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.51■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 ROCK1Q13464 1354 aa16.49■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADGRL2O95490 1459 aa16.48■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 NOS1P29475 1434 aa16.48■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 C14orf37Q86TY3 774 aa16.48■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 RXRBP28702 533 aa16.47■□□□□ 0.23
CD27-AS1-204ENST00000504270 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa16.45■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa16.45■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZFYVE9O95405 1425 aa16.45■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 DIP2AQ14689 1571 aa16.44■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 RIMS2Q9UQ26 1411 aa16.44■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC52A1Q9NWF4 448 aa16.43■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa16.43■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa16.42■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATF3P18847 181 aa16.41■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 CADPS2Q86UW7 1296 aa16.4■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 AFF2P51816 1311 aa16.4■□□□□ 0.22
CD27-AS1-204ENST00000504270 NHSL1Q5SYE7 1610 aa16.38■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 C19orf44Q9H6X5 657 aa16.38■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 TBX22Q9Y458 520 aa16.38■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 RGS12O14924 1447 aa16.37■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 HDGFP51858 240 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 NAIPQ13075 1403 aa16.36■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.36■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa16.36■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 CHGAP10645 457 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 BRINP3Q76B58 766 aa16.36■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 HFM1A2PYH4 1435 aa16.36■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRPM2O94759 1503 aa16.35■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUP155O75694 1391 aa16.34■□□□□ 0.21
CD27-AS1-204ENST00000504270 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 C8orf37Q96NL8 207 aa16.33■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 PIK3R4Q99570 1358 aa16.32■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.32■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 E9PCH4 1651 aa16.31■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 UNC13BO14795 1591 aa16.31■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 PTPRUQ92729 1446 aa16.3■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.3■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 DCCP43146 1447 aa16.29■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.28■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 MST1RQ04912 1400 aa16.28■□□□□ 0.2
CD27-AS1-204ENST00000504270 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.27■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATAD2Q6PL18 1390 aa16.26■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 PNPLA6Q8IY17 1366 aa16.26■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 NALCNQ8IZF0 1738 aa16.26■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADAMTS2O95450 1211 aa16.24■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 NGLY1Q96IV0 654 aa16.24■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa16.23■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa16.23■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.22■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.22■□□□□ 0.19
CD27-AS1-204ENST00000504270 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.19■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 FOXD1Q16676 465 aa16.19■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 USP21Q9UK80 565 aa16.19■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 MPHOSPH9Q99550 1183 aa16.18■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 LAMC1P11047 1609 aa16.18■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa16.17■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 HRCP23327 699 aa16.17■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 METP08581 1390 aa16.16■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 EP400Q96L91 3159 aa16.16■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.15■□□□□ 0.18
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATRNO75882 1429 aa16.14■□□□□ 0.17
CD27-AS1-204ENST00000504270 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
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