RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498160.5

CTDSP1-215, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 877 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-215ENST00000498160 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 EID1Q9Y6B2 187 aa25.33■■□□□ 1.65
CTDSP1-215ENST00000498160 ZFYVE9O95405 1425 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 RGL3Q3MIN7 710 aa25.32■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 PPLO60437 1756 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 MYOM2P54296 1465 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.31■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 IFT172Q9UG01 1749 aa25.3■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.29■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTDSP1-215ENST00000498160 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.24■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.22■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 MED14O60244 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.21■■□□□ 1.63
CTDSP1-215ENST00000498160 LAMC1P11047 1609 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.17■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 PIK3C2GO75747 1445 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 LTKP29376 864 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 HSPA2P54652 639 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 DIP2AQ14689 1571 aa25.16■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.15■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.14■■□□□ 1.62
CTDSP1-215ENST00000498160 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDSP1-215ENST00000498160 IQGAP1P46940 1657 aa25.13■■□□□ 1.61
CTDSP1-215ENST00000498160 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.12■■□□□ 1.61
CTDSP1-215ENST00000498160 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-215ENST00000498160 BCANQ96GW7 911 aa25.1■■□□□ 1.61
CTDSP1-215ENST00000498160 STRCQ7RTU9 1775 aa25.09■■□□□ 1.61
CTDSP1-215ENST00000498160 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.08■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 TBX22Q9Y458 520 aa25.07■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 PIK3R4Q99570 1358 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 ALKQ9UM73 1620 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.04■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.03■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.02■■□□□ 1.6
CTDSP1-215ENST00000498160 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CTDSP1-215ENST00000498160 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CTDSP1-215ENST00000498160 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDSP1-215ENST00000498160 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.98■■□□□ 1.59
CTDSP1-215ENST00000498160 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.97■■□□□ 1.59
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.95■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 ADGRB1O14514 1584 aa24.94■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 NWD1Q149M9 1564 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 METP08581 1390 aa24.91■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 ABCC11Q96J66 1382 aa24.9■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 TECPR2O15040 1411 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 KCNA6P17658 529 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.89■■□□□ 1.58
CTDSP1-215ENST00000498160 DLC1Q96QB1 1528 aa24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 SIRT1Q96EB6 747 aa24.87■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 PTCH1Q13635 1447 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 CPS1P31327 1500 aa24.86■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.84■■□□□ 1.57
CTDSP1-215ENST00000498160 PTPRUQ92729 1446 aa24.82■■□□□ 1.56
CTDSP1-215ENST00000498160 SLC24A1O60721 1099 aa24.8■■□□□ 1.56
CTDSP1-215ENST00000498160 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa24.78■■□□□ 1.56
CTDSP1-215ENST00000498160 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CTDSP1-215ENST00000498160 STK26Q9P289 416 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-215ENST00000498160 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-215ENST00000498160 USP47Q96K76 1375 aa24.77■■□□□ 1.56
CTDSP1-215ENST00000498160 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 POGKQ9P215 609 aa24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.72■■□□□ 1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
CTDSP1-215ENST00000498160 PRAM1Q96QH2 718 aa24.7■■□□□ 1.54
CTDSP1-215ENST00000498160 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.68■■□□□ 1.54
CTDSP1-215ENST00000498160 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.67■■□□□ 1.54
CTDSP1-215ENST00000498160 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDSP1-215ENST00000498160 ADGRB2O60241 1585 aa24.66■■□□□ 1.54
CTDSP1-215ENST00000498160 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDSP1-215ENST00000498160 TMEM94Q12767 1356 aa24.65■■□□□ 1.54
CTDSP1-215ENST00000498160 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.64■■□□□ 1.53
CTDSP1-215ENST00000498160 DCCP43146 1447 aa24.63■■□□□ 1.53
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