RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
TSPAN4-212ENST00000494815 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.6■■□□□ 1.69
TSPAN4-212ENST00000494815 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.59■■□□□ 1.69
TSPAN4-212ENST00000494815 BCL11AQ9H165 835 aa25.58■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.57■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.56■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 IQGAP1P46940 1657 aa25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.54■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 PPLO60437 1756 aa25.53■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 TESK2Q96S53 571 aa25.52■■□□□ 1.68
TSPAN4-212ENST00000494815 ERVK-7P63135 1459 aa25.51■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 IDI1Q13907 227 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 PIK3C2GO75747 1445 aa25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.47■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.46■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.45■■□□□ 1.67
TSPAN4-212ENST00000494815 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 TMF1P82094 1093 aa25.45■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.44■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 ZFYVE9O95405 1425 aa25.43■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 MLECQ14165 292 aa25.42■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
TSPAN4-212ENST00000494815 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 SLC24A1O60721 1099 aa25.38■■□□□ 1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 ADGRB1O14514 1584 aa25.36■■□□□ 1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 CDCA8Q53HL2 280 aa25.35■■□□□ 1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 ZMYM3Q14202 1370 aa25.35■■□□□ 1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.34■■□□□ 1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.33■■□□□ 1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPAN4-212ENST00000494815 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
TSPAN4-212ENST00000494815 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPAN4-212ENST00000494815 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPAN4-212ENST00000494815 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 ANP32EQ9BTT0 268 aa25.24■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 MRS2Q9HD23 443 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 RALBP1Q15311 655 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 TNRQ92752 1358 aa25.22■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 CCDC184Q52MB2 194 aa25.21■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 PANK3Q9H999 370 aa25.21■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.21■■□□□ 1.63
TSPAN4-212ENST00000494815 FKBP8Q14318 412 aa25.19■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.18■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.17■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.16■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 BCANQ96GW7 911 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 MYOM1P52179 1685 aa25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 ALKQ9UM73 1620 aa25.14■■□□□ 1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 NLRP1Q9C000 1473 aa25.12■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 NEFLP07196 543 aa25.09■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.08■■□□□ 1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 C3P01024 1663 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.07■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 PTPRMP28827 1452 aa25.06■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 NLRP13Q86W25 1043 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 TMC1Q8TDI8 760 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.05■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 EVC2Q86UK5 1308 aa25.04■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 STK26Q9P289 416 aa25.03■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 DLC1Q96QB1 1528 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.02■■□□□ 1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TSPAN4-212ENST00000494815 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.01■■□□□ 1.59
TSPAN4-212ENST00000494815 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TSPAN4-212ENST00000494815 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
TSPAN4-212ENST00000494815 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
TSPAN4-212ENST00000494815 ABCC11Q96J66 1382 aa24.97■■□□□ 1.59
TSPAN4-212ENST00000494815 PRAM1Q96QH2 718 aa24.97■■□□□ 1.59
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