RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF40O75150 1001 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC4A3P48751 1232 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 SLF2Q8IX21 1173 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 ZMYND10O75800 440 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 BARGINQ6ZT62 677 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 NECTIN2Q92692 538 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 PHOX2BQ99453 314 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 NLRP7Q8WX94 980 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 CCDC102AQ96A19 550 aa7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 APLP1P51693 650 aa7.15□□□□□ -1.26
ANKRD28-211ENST00000492895 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC10A3P09131 477 aa7.13□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.13□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 PRR14Q9BWN1 585 aa7.12□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 CFHP08603 1231 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 KCNC4Q03721 635 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 IFFO2Q5TF58 517 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 SULF1Q8IWU6 871 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 KMT5BQ4FZB7 885 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 RDH13Q8NBN7 331 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 MTRQ99707 1265 aa7.1□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
ANKRD28-211ENST00000492895 CLCN1P35523 988 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 AK7Q96M32 723 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 IL21Q9HBE4 155 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.08□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 COPS2P61201 443 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 TRIM66O15016 1216 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 GCGRP47871 477 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 AMHR2Q16671 573 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF516Q92618 1163 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.06□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 CD46P15529 392 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 A0A0G2JS52 829 aa7.03□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 ZPR1O75312 459 aa7.03□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 FUT2Q10981 343 aa7.03□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
ANKRD28-211ENST00000492895 NR1I2O75469 434 aa7.02□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 ATP6V1AP38606 617 aa7.02□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 NKX2-3Q8TAU0 364 aa7.02□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 SCUBE3Q8IX30 993 aa7.01□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 KDM4AO75164 1064 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 PDE4DQ08499 809 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 GRIPAP1Q4V328 841 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 MORN1Q5T089 497 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 PARP9Q8IXQ6 854 aa7□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 USP46P62068 366 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.98□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 TLL1O43897 1013 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 PPP1R18Q6NYC8 613 aa6.97□□□□□ -1.29
ANKRD28-211ENST00000492895 RGS20O76081 388 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 ADH1BP00325 375 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 GGCXP38435 758 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.96□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXA2O43364 376 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 MS4A1P11836 297 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 THAP11Q96EK4 314 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 SPSB2Q99619 263 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 BRICD5Q6PL45 260 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 HLA-CQ95604 372 aa6.94□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 S1PR4O95977 384 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 Q3C1V9 767 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC6A16Q9GZN6 736 aa6.93□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 GUCA2AQ02747 115 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF223E7ERA6 249 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 FDX1P10109 184 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 NDUFV2P19404 249 aa6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
ANKRD28-211ENST00000492895 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-211ENST00000492895 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-211ENST00000492895 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD28-211ENST00000492895 MSS51Q4VC12 460 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms