RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491530.5

CHTF18-211, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 819 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-211ENST00000491530 ALKQ9UM73 1620 aa22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-211ENST00000491530 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-211ENST00000491530 LTKP29376 864 aa22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-211ENST00000491530 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-211ENST00000491530 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-211ENST00000491530 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-211ENST00000491530 EID1Q9Y6B2 187 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-211ENST00000491530 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-211ENST00000491530 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-211ENST00000491530 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-211ENST00000491530 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-211ENST00000491530 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.85■■□□□ 1.25
CHTF18-211ENST00000491530 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.85■■□□□ 1.25
CHTF18-211ENST00000491530 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CHTF18-211ENST00000491530 IDI1Q13907 227 aa22.83■■□□□ 1.25
CHTF18-211ENST00000491530 FOXD1Q16676 465 aa22.8■■□□□ 1.24
CHTF18-211ENST00000491530 NWD1Q149M9 1564 aa22.8■■□□□ 1.24
CHTF18-211ENST00000491530 ZFYVE9O95405 1425 aa22.79■■□□□ 1.24
CHTF18-211ENST00000491530 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.78■■□□□ 1.24
CHTF18-211ENST00000491530 TRPM2O94759 1503 aa22.76■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 BCANQ96GW7 911 aa22.75■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 TMEM94Q12767 1356 aa22.73■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 CLTCL1P53675 1640 aa22.72■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 KCNA6P17658 529 aa22.71■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.71■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CHTF18-211ENST00000491530 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.69■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.67■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 DIP2AQ14689 1571 aa22.67■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.65■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 KIF1BO60333 1816 aa22.65■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.65■■□□□ 1.22
CHTF18-211ENST00000491530 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.63■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.61■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.6■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 MSH6P52701 1360 aa22.6■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.59■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.58■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.58■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
CHTF18-211ENST00000491530 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CHTF18-211ENST00000491530 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CHTF18-211ENST00000491530 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CHTF18-211ENST00000491530 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CHTF18-211ENST00000491530 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.55■■□□□ 1.2
CHTF18-211ENST00000491530 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
CHTF18-211ENST00000491530 SLAIN2Q9P270 581 aa22.53■■□□□ 1.2
CHTF18-211ENST00000491530 PPLO60437 1756 aa22.53■■□□□ 1.2
CHTF18-211ENST00000491530 C14orf37Q86TY3 774 aa22.51■■□□□ 1.19
CHTF18-211ENST00000491530 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.51■■□□□ 1.19
CHTF18-211ENST00000491530 TBX22Q9Y458 520 aa22.51■■□□□ 1.19
CHTF18-211ENST00000491530 IFT172Q9UG01 1749 aa22.51■■□□□ 1.19
CHTF18-211ENST00000491530 PHLPP1O60346 1717 aa22.47■■□□□ 1.19
CHTF18-211ENST00000491530 POTEAQ6S8J7 498 aa22.46■■□□□ 1.19
CHTF18-211ENST00000491530 PIK3R4Q99570 1358 aa22.45■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.44■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 PTPRUQ92729 1446 aa22.43■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 RGL3Q3MIN7 710 aa22.43■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 JCADQ9P266 1359 aa22.42■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa22.41■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 NEUROD1Q13562 356 aa22.41■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.39■■□□□ 1.18
CHTF18-211ENST00000491530 ATF3P18847 181 aa22.39■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 CADPS2Q86UW7 1296 aa22.39■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 C19orf44Q9H6X5 657 aa22.39■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.39■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.39■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.36■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 MYOM2P54296 1465 aa22.34■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CHTF18-211ENST00000491530 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.32■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.32■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 LRP6O75581 1613 aa22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 DCCP43146 1447 aa22.31■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 METP08581 1390 aa22.3■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 BRINP3Q76B58 766 aa22.3■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.3■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.3■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.29■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 PIK3C2GO75747 1445 aa22.28■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 TONSLQ96HA7 1378 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 PTCH1Q13635 1447 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.27■■□□□ 1.16
CHTF18-211ENST00000491530 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CHTF18-211ENST00000491530 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.8 ms