RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 DRC7Q8IY82 874 aa21.13■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 ROCK1Q13464 1354 aa21.12■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 GNAI1P63096 354 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.09■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.08■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
NISCH-213ENST00000489895 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.08■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa21.07■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.07■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 KIF16BQ96L93 1317 aa21.07■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 FAM161AQ3B820 660 aa21.06■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.06■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 AAMPQ13685 434 aa21.06■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.06■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 CABP2Q9NPB3 220 aa21.06■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 COG6Q9Y2V7 657 aa21.06■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 TPM4P67936 248 aa21.05■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.05■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.05■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.05■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.04■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 CRBNQ96SW2 442 aa21.04■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.04■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.04■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 PLIN1O60240 522 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 RILPL2Q969X0 211 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 TOMM22Q9NS69 142 aa21.03■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 CLSTN1O94985 981 aa21.02■□□□□ 0.96
NISCH-213ENST00000489895 TIAM1Q13009 1591 aa21.02■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 NLRP6P59044 892 aa21.01■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.01■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.956e-7■■□□□ 12.5
NISCH-213ENST00000489895 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa21■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa20.99■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.99■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.99■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 PDE4AP27815 886 aa20.98■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 REC8O95072 547 aa20.98■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 DAPK1P53355 1430 aa20.97■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 HMOX1P09601 288 aa20.96■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 PHF14O94880 888 aa20.96■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 MTHFSP49914 203 aa20.96■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 NLRP2Q9NX02 1062 aa20.96■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.96■□□□□ 0.95
NISCH-213ENST00000489895 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.95■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP20.95■□□□□ 0.941e-8■□□□□ 10.7
NISCH-213ENST00000489895 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.95■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.94■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 PRAM1Q96QH2 718 aa20.94■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.94■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 IQGAP2Q13576 1575 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.93■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 ABTB2Q8N961 1025 aa20.92■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.92■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 USP35Q9P2H5 1018 aa20.91■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 NECTIN2Q92692 538 aa20.91■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 CUL7Q14999 1698 aa20.91■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.91■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 H3BQV1 296 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 PPP2R1AP30153 589 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 IFFO2Q5TF58 517 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 MSH5O43196 834 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-213ENST00000489895 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.89■□□□□ 0.94
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