RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486517.5

C1orf61-217, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 726 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-217ENST00000486517 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.27■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 MSH6P52701 1360 aa24.27■■□□□ 1.48
C1orf61-217ENST00000486517 SLAIN2Q9P270 581 aa24.25■■□□□ 1.47
C1orf61-217ENST00000486517 TRIM52Q96A61 297 aa24.24■■□□□ 1.47
C1orf61-217ENST00000486517 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.24■■□□□ 1.47
C1orf61-217ENST00000486517 LRP6O75581 1613 aa24.24■■□□□ 1.47
C1orf61-217ENST00000486517 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
C1orf61-217ENST00000486517 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
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C1orf61-217ENST00000486517 IDI1Q13907 227 aa24.17■■□□□ 1.46
C1orf61-217ENST00000486517 SHPRHQ149N8 1683 aa24.17■■□□□ 1.46
C1orf61-217ENST00000486517 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
C1orf61-217ENST00000486517 ADGRB3O60242 1522 aa24.15■■□□□ 1.46
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C1orf61-217ENST00000486517 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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C1orf61-217ENST00000486517 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.09■■□□□ 1.45
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C1orf61-217ENST00000486517 DIP2AQ14689 1571 aa24.02■■□□□ 1.44
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C1orf61-217ENST00000486517 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
C1orf61-217ENST00000486517 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
C1orf61-217ENST00000486517 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24■■□□□ 1.43
C1orf61-217ENST00000486517 CADPS2Q86UW7 1296 aa23.99■■□□□ 1.43
C1orf61-217ENST00000486517 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
C1orf61-217ENST00000486517 AFF2P51816 1311 aa23.98■■□□□ 1.43
C1orf61-217ENST00000486517 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa23.98■■□□□ 1.43
C1orf61-217ENST00000486517 UNC13BO14795 1591 aa23.97■■□□□ 1.43
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C1orf61-217ENST00000486517 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.96■■□□□ 1.43
C1orf61-217ENST00000486517 RGS12O14924 1447 aa23.95■■□□□ 1.42
C1orf61-217ENST00000486517 C19orf44Q9H6X5 657 aa23.95■■□□□ 1.42
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C1orf61-217ENST00000486517 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.93■■□□□ 1.42
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C1orf61-217ENST00000486517 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.88■■□□□ 1.41
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C1orf61-217ENST00000486517 PIK3R4Q99570 1358 aa23.86■■□□□ 1.41
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C1orf61-217ENST00000486517 TRPM2O94759 1503 aa23.83■■□□□ 1.41
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C1orf61-217ENST00000486517 NGLY1Q96IV0 654 aa23.77■■□□□ 1.4
C1orf61-217ENST00000486517 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.77■■□□□ 1.4
C1orf61-217ENST00000486517 FOXD1Q16676 465 aa23.76■■□□□ 1.39
C1orf61-217ENST00000486517 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.76■■□□□ 1.39
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C1orf61-217ENST00000486517 E9PCH4 1651 aa23.73■■□□□ 1.39
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C1orf61-217ENST00000486517 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa23.7■■□□□ 1.38
C1orf61-217ENST00000486517 NALCNQ8IZF0 1738 aa23.67■■□□□ 1.38
C1orf61-217ENST00000486517 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
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C1orf61-217ENST00000486517 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.65■■□□□ 1.38
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C1orf61-217ENST00000486517 EP400Q96L91 3159 aa23.64■■□□□ 1.38
C1orf61-217ENST00000486517 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.64■■□□□ 1.37
C1orf61-217ENST00000486517 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa23.64■■□□□ 1.37
C1orf61-217ENST00000486517 LAMC1P11047 1609 aa23.63■■□□□ 1.37
C1orf61-217ENST00000486517 ATRNO75882 1429 aa23.61■■□□□ 1.37
C1orf61-217ENST00000486517 CCDC125Q86Z20 511 aa23.6■■□□□ 1.37
C1orf61-217ENST00000486517 PTCH1Q13635 1447 aa23.59■■□□□ 1.37
C1orf61-217ENST00000486517 METP08581 1390 aa23.58■■□□□ 1.37
C1orf61-217ENST00000486517 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
C1orf61-217ENST00000486517 C1orf167Q5SNV9 1468 aa23.57■■□□□ 1.36
C1orf61-217ENST00000486517 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
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