RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.57■■□□□ 1.68
ATG4B-217ENST00000475693 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.56■■□□□ 1.68
ATG4B-217ENST00000475693 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
ATG4B-217ENST00000475693 IFT172Q9UG01 1749 aa25.56■■□□□ 1.68
ATG4B-217ENST00000475693 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.55■■□□□ 1.68
ATG4B-217ENST00000475693 PPLO60437 1756 aa25.55■■□□□ 1.68
ATG4B-217ENST00000475693 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.55■■□□□ 1.68
ATG4B-217ENST00000475693 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.54■■□□□ 1.68
ATG4B-217ENST00000475693 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.51■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 MYOM2P54296 1465 aa25.51■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 USP47Q96K76 1375 aa25.51■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.5■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 PTPRMP28827 1452 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 STAC3Q96MF2 364 aa25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 PIK3C2GO75747 1445 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 LTKP29376 864 aa25.45■■□□□ 1.67
ATG4B-217ENST00000475693 NLRP1Q9C000 1473 aa25.45■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 ZFYVE9O95405 1425 aa25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 BCANQ96GW7 911 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-217ENST00000475693 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.38■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 STK26Q9P289 416 aa25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.36■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.36■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
ATG4B-217ENST00000475693 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRB1O14514 1584 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 ALKQ9UM73 1620 aa25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 TESK2Q96S53 571 aa25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 EID1Q9Y6B2 187 aa25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 LAMC1P11047 1609 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 METP08581 1390 aa25.27■■□□□ 1.64
ATG4B-217ENST00000475693 IQGAP1P46940 1657 aa25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.26■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 SLIT1O75093 1534 aa25.25■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 HSPA2P54652 639 aa25.24■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 CCDC7Q96M83 1385 aa25.24■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.23■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.22■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.22■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.21■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.2■■□□□ 1.63
ATG4B-217ENST00000475693 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-217ENST00000475693 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.2■■□□□ 1.62
ATG4B-217ENST00000475693 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-217ENST00000475693 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ATG4B-217ENST00000475693 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-217ENST00000475693 PRAM1Q96QH2 718 aa25.17■■□□□ 1.62
ATG4B-217ENST00000475693 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
ATG4B-217ENST00000475693 TMF1P82094 1093 aa25.13■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 MIER1Q8N108 512 aa25.13■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.13■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 POGKQ9P215 609 aa25.12■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 PTPRUQ92729 1446 aa25.11■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 MED14O60244 1454 aa25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 TBX22Q9Y458 520 aa25.09■■□□□ 1.61
ATG4B-217ENST00000475693 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa25.08■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 ABCC11Q96J66 1382 aa25.06■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 ROBO2Q9HCK4 1378 aa25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.04■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 CABP2Q9NPB3 220 aa25.03■■□□□ 1.6
ATG4B-217ENST00000475693 KCNA6P17658 529 aa25.01■■□□□ 1.59
ATG4B-217ENST00000475693 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-217ENST00000475693 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-217ENST00000475693 PANK3Q9H999 370 aa24.97■■□□□ 1.59
ATG4B-217ENST00000475693 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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